擬時(shí)（pseudotime）分析，又稱細(xì)胞軌跡（cell trajectory）分析颓帝，通過(guò)擬時(shí)分析可以推斷出發(fā)育過(guò)程細(xì)胞的分化軌跡或細(xì)胞亞型的演化過(guò)程米碰，在發(fā)育相關(guān)研究中使用頻...
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scRNA-seq擬時(shí)分析 || Monocle2 踩坑教程 -
開(kāi)刊詞||單細(xì)胞新藥研發(fā)導(dǎo)論將單細(xì)胞研究的基本思路與新藥研發(fā)的成熟管線結(jié)合起來(lái)。 人购城，是萬(wàn)物的尺度吕座。 自生命科學(xué)誕生之日起，就開(kāi)始支撐生物醫(yī)藥的孵育和發(fā)展瘪板，而生物醫(yī)藥也是生命科學(xué)的最終出口吴趴。海量單細(xì)胞技...
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為什么要以數(shù)據(jù)庫(kù)的思維來(lái)理解單細(xì)胞數(shù)據(jù)在我們涉足單細(xì)胞數(shù)據(jù)分析不久之后就會(huì)發(fā)現(xiàn)，我們?cè)诤鸵惶仔碌睦砟畲蚪坏琅袼АＴ谶@套理念中史侣，對(duì)象是常見(jiàn)的拴泌，數(shù)據(jù)是多維的，往往是一張核心表及其附屬惊橱。我們對(duì)一張表是熟悉的蚪腐，Excel極大...
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解螺旋《KEGG信號(hào)通路數(shù)據(jù)庫(kù)使用教程》學(xué)習(xí)筆記KEGG Kyoto Encyclopedia of Genes and Genomes 京都基因與基因組百科全書(shū) 特點(diǎn)： 綜合數(shù)據(jù)庫(kù)，建立了跨物種聯(lián)系税朴。 基于可計(jì)算的形式捕...
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R Markdown 使用
一回季、簡(jiǎn)介 R Markdown是通過(guò)R來(lái)書(shū)寫可重復(fù)動(dòng)態(tài)報(bào)告的?種格式。利?它在幻燈?正林、pdf泡一、html?檔、Word?件中嵌?R代碼和結(jié)果觅廓。 二鼻忠、生成中文PDF： 1. 下載...
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初生牛犢--模仿cell research (IF 17+) 文章的一張圖前言 我之前寫過(guò)這篇文章的精讀筆記：?jiǎn)渭?xì)胞好文2--Single-cell RNA-seq highlights intra-tumoral heterogeneity an...
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老板親自傳授的文獻(xiàn)閱讀方法前言 論一個(gè)氣場(chǎng)合適的導(dǎo)師的重要性瞳脓。想起一個(gè)微信朋友前截圖 A：導(dǎo)師牛不牛塑娇，師兄師姐牛不牛，跟你牛不牛沒(méi)有關(guān)系 B：你錯(cuò)啦劫侧，導(dǎo)師牛不牛埋酬，師兄師姐牛不牛，很大程度上決定我牛不牛...
