SFS的基本理解汰蓉、介紹的一篇文章：https://theg-cat.com/tag/joint-sfs/[https://theg-cat.com/tag/joint-sfs...
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種群動(dòng)態(tài)歷史評(píng)估方法之 SFS（Site/Allele Frequency Spectrum） -
jcvi畫(huà)兩物種的共線(xiàn)性圖參考：https://github.com/tanghaibao/jcvi/wiki/MCscan-(Python-version)[https://github.com/t...
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基因家族擴(kuò)張與收縮分析及物種進(jìn)化樹(shù)構(gòu)建（上）一肩祥、數(shù)據(jù)準(zhǔn)備 首先授艰，選取不同物種的Protein數(shù)據(jù)集：Arabidopsis_thaliana.fa；Citrus_grandis.fa巾表；Dimocarpus_longan...
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「基因組學(xué)」使用CAFE進(jìn)行基因家族擴(kuò)張收縮分析環(huán)境準(zhǔn)備 安裝軟件: 參考「基因組學(xué)」使用OrthoFinder進(jìn)行直系同源基因分析 安裝OrthoFinder，然后再安裝CAFE 數(shù)據(jù)準(zhǔn)備: 一共會(huì)分析mouse, r...
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【比較基因組學(xué)】基因家族擴(kuò)張與收縮分析前言：因?yàn)樽罱戧懤m(xù)續(xù)接手了幾個(gè)物種的基因組項(xiàng)目，這也是生信分析中很大的一塊孔祸。其中最基礎(chǔ)的是組裝和注釋?zhuān)ó?dāng)然我們實(shí)驗(yàn)室也做組裝方法學(xué)的研究）。現(xiàn)在隨著很多物種基因組的發(fā)表发皿，純...
