背景 目前市面上的腫瘤靶向用藥基因檢測(cè)Panel已非常常見朦前，除了直觀層面的gene種類、數(shù)目悯辙、捕獲建庫(kù)方法的不同外遗锣，對(duì)于腫瘤panel货裹， 探針定制之初相關(guān)的MSI位點(diǎn)、...
發(fā)簡(jiǎn)信
IP屬地：上海
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NGS基因檢測(cè)Panel的探針設(shè)計(jì) -
sanger測(cè)序結(jié)果分析
這個(gè)知識(shí)來之https://mp.weixin.qq.com/s?src=11×tamp=1601291787&ver=2612&signature=w3900vK...
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WGCNA實(shí)例分析及解讀（附代碼）WGCNA分析基于兩個(gè)假設(shè)：1.相似表達(dá)模式的基因可能存在共調(diào)控、功能相關(guān)或處于同一通路还最，2.基因網(wǎng)絡(luò)符合無尺度分布墓阀。基于這兩點(diǎn)拓轻，可以將基因網(wǎng)絡(luò)根據(jù)表達(dá)相似性劃分為不同的模塊...
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轉(zhuǎn)錄因子詳細(xì)介紹(motif)TF: transcription factor轉(zhuǎn)錄因子TFBS: transcription factor binding site轉(zhuǎn)錄因子結(jié)合位點(diǎn)TFBS是序列內(nèi)的loc...
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Motif和domain的區(qū)別Protein domain： 結(jié)構(gòu)域的概念由Wetlaufer于1973年首次提出斯撮，他定義結(jié)構(gòu)域?yàn)榭梢宰詣?dòng)折疊的穩(wěn)定的蛋白質(zhì)結(jié)構(gòu)單位。過去扶叉，結(jié)構(gòu)域被描述為勿锅，折疊單位，致密結(jié)...
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生物數(shù)據(jù)庫(kù)
生物數(shù)據(jù)庫(kù) 基本序列格式 1.FASTA格式：首行為描述行枣氧，以>為起始溢十，其后為描述信息；第二行即為原始序列达吞。2.FASTQ格式:FASTQ格式包括四部分信息：第一行為包含序列...
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轉(zhuǎn)錄組數(shù)據(jù)庫(kù)的基本使用（一）-GO數(shù)據(jù)庫(kù)轉(zhuǎn)錄組數(shù)據(jù)庫(kù)的基本使用（一）-GO數(shù)據(jù)庫(kù) 轉(zhuǎn)錄組數(shù)據(jù)庫(kù)有哪些张弛？ 目前在對(duì)轉(zhuǎn)錄組數(shù)據(jù)進(jìn)行分析的時(shí)候，很多測(cè)序公司通常使用以下數(shù)據(jù)庫(kù)： GOhttp://www.geneonto...
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[轉(zhuǎn)錄組] 生物學(xué)重復(fù)到底設(shè)定多少個(gè)合適
我打算做一個(gè)RNA-seq項(xiàng)目，研究一株細(xì)菌在兩個(gè)環(huán)境條件下的表達(dá)差異⊥萄迹現(xiàn)在寺董，我打算確定生物學(xué)重復(fù)的個(gè)數(shù)，以便可以得到統(tǒng)計(jì)學(xué)上有意義的結(jié)果刻剥。我打算每個(gè)環(huán)境的樣本設(shè)置兩個(gè)生物學(xué)...
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可變剪切軟件CASH測(cè)試
可變剪切介紹： 什么是基因的可變剪切遮咖？ 有些基因的前體mRNA（pre-mRNA）通過不同的剪接方式（選擇不同的剪接位點(diǎn)）產(chǎn)生不同的mRNA剪接異構(gòu)體，這一過程稱為可變剪接（...
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【如何提問】以我最近的一次提問為例
只要開始學(xué)習(xí)造虏，就會(huì)出現(xiàn)疑問御吞。即便一個(gè)作者認(rèn)為自己講的多么具體，但是由于“知識(shí)的詛咒”存在漓藕，必然有一些點(diǎn)是他認(rèn)為理所當(dāng)然陶珠，但是讀者/聽眾卻從未聽過的現(xiàn)象。譬如享钞，之前在生信媛舉辦...
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RNA-seq的標(biāo)準(zhǔn)化方法羅列
RNA-seq的標(biāo)準(zhǔn)化方法 對(duì)于RNA-seq而言背率，由于 技術(shù)誤差， 測(cè)序深度不同嫩与， 基因長(zhǎng)度不同寝姿，為了能夠比較不同的樣本，比較不同的基因的表達(dá)量划滋，以及使表達(dá)水品分布符合統(tǒng)計(jì)...
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個(gè)人博客: xuzhougeng.top (隨緣訪問)
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斜杠青年/偽醫(yī)生/偽專欄作家/偽攝影愛好者/偽古典音樂愛好者/偽旅行家/假裝文藝青年/客居英倫15年/精游43國(guó)家與地區(qū)/千萬博主/千萬小心加我好友/千萬。同窘。玄帕。
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偶爾拍花丧没，隨意喝茶鹰椒，簡(jiǎn)單人生，留點(diǎn)印記……
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