前言： 這篇主要記一下如何使得本地的文件輸出到網(wǎng)頁上杂腰。（1）將通過flask_sqlalchemy把python和sql數(shù)據(jù)庫聯(lián)系起來豫缨，把你的文件上傳到數(shù)據(jù)庫上。（2）使用f...
發(fā)簡信
IP屬地：廣東
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Flask-sqlalchemy讀取文件到數(shù)據(jù)庫并輸出到網(wǎng)頁上 -
解決問題‘~/anaconda3/etc/conda/deactivate.d/deactivate-gxx_linux-64.sh: Syntax error: "(" unexpected’
系統(tǒng)：Debian在shell中輸入sudo dpkg-reconfigure dash阱缓，在彈出的頁面中選擇'no'。
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雙端測序的mRNA-seq處理過程
1.從SRA數(shù)據(jù)庫選擇原始測序數(shù)據(jù)并下載【下載之前看一眼是single還是paired】 結果：在執(zhí)行命令的目錄下出現(xiàn)SRR1186241_1.fastq和SRR118624...
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TCGA-miRNA的生存分析引言：之前寫了mRNA的生存分析，對于miRNA來說基本一致，只不過因為從TCGA上下載的miRNA的reads文件和mRNA有一點不一樣宽菜，需要額外處理一下。TCGA-mRN...
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karyoploteR畫enhancer附近的信號分布效果圖： 感覺就一個不好理解的參數(shù)：r0和r1r0：是起始的高度r1：是結束的高度r1-r0才是我們想要展示內容的高度（想象這個畫布本身就有刻度線） 傳入的增強子文件格式：前...
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TCGA-mRNA的生存分析引言：本文主要記錄mRNA生存分析過程中遇到的問題以及具體過程竿报，生存分析用的是最常見的KM法Kaplan-Meier铅乡。 工具：TCGA的數(shù)據(jù)通過library(TCGAbio...
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不常上線阵幸，有事可以找@547的小書童呀
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用TCGAbiolinks從TCGA數(shù)據(jù)下載到下游分析的學習筆記
前言 之前一直在用RTCGA包下載數(shù)據(jù)，看著永不更新的數(shù)據(jù)芽世，心里總覺得怪怪的挚赊，于是下定決心重新學習一個好用的包——TCGAbiolinks。這個包調用GDC的API济瓢，應該是最...
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js中++i和i++的理解
關于++i和i++的理解 最常聽說的一句話就是：前置遞增：先遞增后賦值后置遞增：先賦值后遞增 再加上常用的寫法是a=i++這種荠割，有的用運算優(yōu)先級解釋的(很明顯也不成立)，就沒...
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Bowtie Error: Saw ASCII character 10 but expected 33-based Phred qual
關于這個問題的解決方法：是解答說因為有長度為0的測序數(shù)據(jù)旺矾。所以使用cutadapt 的-m參數(shù) 設置一個最短序列長度涨共，去掉太短的測序結果。 參考：https://github...
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對JavaScript的Event對象的理解
今天寫一下個人覺得在JS中比較重要又比較獨特的對象--Event對象以及應用宠漩。 －簡單介紹JS－ 談到javascript举反，很多人(比如我)總想探究一下它和Java的關系，其...
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生物信息系列：根據(jù)成對bed文件以及多個BigWig文件畫出信號圖
引言：本期文章是記錄一下如何利用一對bed文件以及多個BigWig文件提取信號值并進行畫圖的實現(xiàn)過程扒吁。 Materials：兩個bed文件火鼻，多個ENCODE數(shù)據(jù)庫下載的組蛋白...
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pandas用法歸納＋簡單的文件處理命令
古人云：溫故而知新。最近把pandas的一些常用的方法以及一些處理文件的常用命令用法總結了一下雕崩，因為再不復習就真忘了魁索。 01 — pandas Q1:有時候列數(shù)很多，不可能手...
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HTML5之localStorage實現(xiàn)“是否保存密碼”
“ 最近學習了一下關于web應用的本地儲存，一個簡單的例子就是平時在登陸界面的“是否保存密碼”饶火，所以主要列出實現(xiàn)的腳本以及學習中遇到的問題” 背景： 本地存儲：包括web-S...
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HTML <label> 標簽<label> 標簽的作用 在HTML中 標簽不會向用戶展示任何特殊內容,它的作用是把自己與其他標簽"綁定"起來鹏控，也可以說是與其他元素關聯(lián)到一起，粗暴點說就是 有一腿肤寝。 與其...
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HTML <label> 標簽
<label> 標簽的作用 在HTML中 標簽不會向用戶展示任何特殊內容,它的作用是把自己與其他標簽"綁定"起來当辐，也可以說是與其他元素關聯(lián)到一起，粗暴點說就是 有一腿鲤看。 與其...
