R語言基礎(chǔ)系列： R語言基礎(chǔ)1--R數(shù)據(jù)格式：.rds和.rda的區(qū)別[http://www.reibang.com/p/6a824548887b] R語言基礎(chǔ)2--數(shù)據(jù)排...
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R語言基礎(chǔ)3--tidyverse包總結(jié)
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利用HOMER預(yù)測(cè)目標(biāo)序列的motif（從運(yùn)行程序到結(jié)果解讀浊仆，以及注意事項(xiàng)）關(guān)于查找motif轩端，目前有很多種軟件可以進(jìn)行預(yù)測(cè)难衰。我所在的實(shí)驗(yàn)室通常使用FIMO（MEME套件里的一個(gè)）蜕劝，但是有很多文獻(xiàn)里也提到了HOMER這個(gè)軟件，并且不乏一些影響因子很高...
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不好好作圖的NCS系列(二)：3D版的PCA圖
PCA圖我們之前講過了（轉(zhuǎn)錄組不求人系列(三)：PCA分析及CNS級(jí)別作圖[http://mp.weixin.qq.com/s?__biz=Mzg5OTYzMzY5Ng==&...
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R語言可視化（十三）：氣泡圖繪制13. 富集氣泡圖繪制 清除當(dāng)前環(huán)境中的變量 設(shè)置工作目錄 讀取示例數(shù)據(jù) 基礎(chǔ)symbols函數(shù)繪制氣泡圖 ggplot2包繪制富集氣泡圖 ggpubr包繪制富集氣泡圖
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豆豆文獻(xiàn)閱讀第二天文章題目：Transcript-level expression analysis of RNA-seq experiments with HISAT, StringTie ...
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箱線圖（Box Plot）理論篇記得之前應(yīng)該整理過的赂蠢，但是找不到了磺樱，就再來一次吧 箱線圖 箱形圖又稱為盒須圖、箱線圖 是一種用作顯示一組數(shù)據(jù)分散情況的統(tǒng)計(jì)圖磅网，因形狀如箱子得名 箱形圖針對(duì)的是單一變量谈截，可以用...
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個(gè)人向ggplot2箱線圖總結(jié)主要從如何看圖、用圖與作圖三個(gè)方面來對(duì)箱線圖進(jìn)行理解和總結(jié)涧偷。 1簸喂、看圖 如圖所示，箱線圖是將一組數(shù)據(jù)按照大小順序排列后進(jìn)行繪制的燎潮，包含6個(gè)數(shù)據(jù)節(jié)點(diǎn)喻鳄，分別表示出數(shù)據(jù)的上邊緣、上...
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R繪圖：ggplot2繪制火山圖火山圖是測(cè)序分析報(bào)告中最為核心的圖片之一确封。繪制火山圖的方法有許多除呵，Excel和第三方軟件等再菊，本文主要運(yùn)用ggplot2和ggrepel兩個(gè)R包演示[1][2]。橫坐標(biāo)為Fol...
