DESeq2文庫(kù)標(biāo)準(zhǔn)化 問(wèn)題1：調(diào)整文庫(kù)大小的差異 樣本1的read是樣本2的一半,樣本2中每個(gè)基因的read是樣本1的兩倍然爆。這種差異不是生物學(xué)造成的躏升，而是測(cè)序深度造成的蝌戒。R...
發(fā)簡(jiǎn)信
IP屬地：重慶
-
12高通量測(cè)序-DESeq2文庫(kù)標(biāo)準(zhǔn)化 -
如何要展示logFC的大小在通路圖里，這個(gè)cpd.data是不是可以理解為KO代謝物對(duì)應(yīng)的gene的FC值
KEGG分析工具：pathview基本操作
什么是KEGG KEGG(Kyoto Encyclopedia of Genes and Genomes)是系統(tǒng)分析基因功能、基因組信息數(shù)據(jù)庫(kù)，它有助于研究者把基因及表達(dá)信息...
-
data(geneList,package="DOSE")是什么意思？geneList是哪里來(lái)的
構(gòu)建自己的R包--KEGG.db
參考地址在使用clusterProfiler時(shí)归敬，KEGG注釋包，可以自定義鄙早。畢竟許多物種的數(shù)據(jù)庫(kù)是不完善的⊥艏耄現(xiàn)在就自定義一個(gè)KEGG.db的包，用于KEGG注釋限番。 簡(jiǎn)單快捷方...
-
前言科學(xué)-3D2Y<br><br>簡(jiǎn)書博客<br><a href="http://www.reibang.com/u/599a9e91afc8" rel="nofollow" target="_blank">http://www.reibang.com/u/599a9e91afc8</a><br><br>CSDN博客<br><a href="https://blog.csdn.net/leadingsci" rel="nofollow" target="_blank">https://blog.csdn.net/leadingsci</a><br><br>微店：<br><a href="https://weidian.com/?userid=583316993&wfr=wx_profile" rel="nofollow" target="_blank">https://weidian.com/?userid=583316993&wfr=wx_profile</a>
-
孫振球, 徐勇勇. 醫(yī)學(xué)統(tǒng)計(jì)學(xué).第4版[M]. 人民衛(wèi)生出版社, 2014. 從R語(yǔ)言和統(tǒng)計(jì)學(xué)小白的過(guò)渡。躯舔。驴剔。 更加優(yōu)質(zhì)的閱讀體驗(yàn)：https://x2yline.github.io/statistics_note/ 簡(jiǎn)書不支持latex語(yǔ)法。粥庄。丧失。
-
《極簡(jiǎn)統(tǒng)計(jì)學(xué)》-幫你快速入門統(tǒng)計(jì)學(xué)作為前數(shù)學(xué)專業(yè)畢業(yè)生，學(xué)過(guò)的概率統(tǒng)計(jì)知識(shí)已經(jīng)忘記得差不多了惜互，對(duì)于統(tǒng)計(jì)學(xué)的概念能清楚記得的也只有方差布讹，標(biāo)準(zhǔn)差和均值了琳拭。正態(tài)分布只記得了一個(gè)曲線圖了，其他性質(zhì)什么的都不記得了描验。更...
-
-
-
視頻在https://www.bilibili.com/video/av49363776 耕魄，如果大家R語(yǔ)言能力不夠，就主要學(xué)習(xí)網(wǎng)頁(yè)工具 https://www.cbioportal.org/ 等等彭谁，如果R語(yǔ)言還行吸奴，就看代碼: https://github.com/jmzeng1314/tcga_example 如果確實(shí)有需要，還可以看看我們的付費(fèi)內(nèi)容：地址是 http://jm.grazy.cn/index/mulitcourse/index.html
-
沒(méi)有什么不是認(rèn)真搞不定的！Ｏ猎啊读处！
-
不看私信<br>看不到的文章是被簡(jiǎn)書鎖了
-
單細(xì)胞實(shí)戰(zhàn)2: Seurat+SingleR--從矩陣到細(xì)胞類型注釋單細(xì)胞數(shù)據(jù)標(biāo)準(zhǔn)分析Seurat流程： Seurat官網(wǎng)：https://satijalab.org/seurat/articles/get_started.html[http...
-
學(xué)習(xí)資料
-
-
HISAT2 Bowtie2 提取唯一比對(duì) unique mapping reads
把read比對(duì)到基因組之后抑胎，需要提取唯一比對(duì)來(lái)進(jìn)行下一步分析燥滑。 bowtie2和HISAT2 都沒(méi)有只輸出唯一比對(duì)的命令，所以需要對(duì)比對(duì)結(jié)果sam文件進(jìn)行提取阿逃，可以通過(guò)sam...
-
淺淺的學(xué)習(xí)歷程<br>生信新手恃锉，打工人搀菩，搬運(yùn)工。<br>像王子文一樣財(cái)務(wù)自由破托，才可實(shí)現(xiàn)生育自由<br>像李子柒一樣把一件事情做到極致肪跋，才可實(shí)現(xiàn)職業(yè)自由
-
-
-
2022年阐虚，魚躍龍門！積極主動(dòng)蚌卤，逆天改命实束！
