TCGA數(shù)據(jù)下載方法：gdc-client胚嘲，Xena和gdcRNAtools 需要下載的數(shù)據(jù)組學(xué)信息（樣本）：（存儲單個病人表達(dá)數(shù)據(jù)岛都，需整理為表達(dá)矩陣） + （存儲樣本文件的...
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TCGA數(shù)據(jù)下載和整理的三種方法 -
snakemake 應(yīng)用介紹
接觸到一個生信分析項目皮仁，作者基于snakemake 串起了17個用python 腳本編寫的分析流程而昨。自己在搭建的Linux 環(huán)境下来氧，測試了這些腳本太示。此文簡要介紹snakema...
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HUMAnN2 宏基因組分析 | 小白版導(dǎo)讀 使用 HUMAnN2（The HMP Unified Metabolic Analysis Network 2）進(jìn)行宏基因組學(xué)分析侥锦。 HUMAnN2 在宏基因組研究中非...
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擴增子和宏基因組分析實用指南 | 微生物組研究
高通量測序技術(shù)和分析方法的發(fā)展為微生物組研究提供了新見解挽荠。然而克胳，這些新的發(fā)展讓研究人員（特別是沒有生物信息背景的研究人員）在選擇合適的分析軟件/腳本上面臨挑戰(zhàn)。 來自中國科學(xué)...
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宏基因組數(shù)據(jù)分析流程代碼熊金波實驗室出品 整理歸納：Larry 本次學(xué)習(xí)使用的服務(wù)器IP地址和其用戶名賬戶密碼如下： 地址：gs0.genek.tv 用戶名：u3276 密碼：genek.tv（建議...
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【單細(xì)胞入門必讀】單細(xì)胞RNA-seq技術(shù)和數(shù)據(jù)分析簡介
Single-Cell RNA-Seq Technologies and Related Computational Data Analysis 單細(xì)胞RNA測序(scRNA...
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R語言 矩陣批量替換殺殺 最近學(xué)了幾個矩陣批量替換的陽間方法圈匆，拒絕for循環(huán)漠另！ 應(yīng)用：數(shù)據(jù)格式的標(biāo)準(zhǔn)化 我們在處理臨床隨訪文件時，醫(yī)生們通常會這樣記錄： 但是我們?nèi)绻M(jìn)行生存分析或者風(fēng)險分析或...
