1.準(zhǔn)備一個(gè)密碼子比對(duì)好的序列 2.使用MEGA打開選擇分析模式 3.選擇核酸序列 4.詢問(wèn)是不是編碼蛋白序列，選擇“是” 5.選擇序列物種類群密碼子表费坊，我選擇的是5號(hào)無(wú)脊椎...
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MEGA導(dǎo)出蛋白編碼序列第1,2位密碼子2021-01-24 -
DU2:如何準(zhǔn)確獲取基因的某個(gè)保守區(qū)域序列需要解決的問(wèn)題： 準(zhǔn)確獲取基因X的某個(gè)保守區(qū)域H的蛋白序列及核酸序列，查看該段序列蛋白層面及核酸層面的變化情況得运。 分析： 需要獲取的基因X的某個(gè)保守區(qū)域序列H中有幾個(gè)氨基酸非...
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動(dòng)物線粒體基因組注釋軟件MITOS2安裝與使用
MITOS2可用于注釋后生動(dòng)物以及真菌等線粒體基因組注釋，主要注釋線粒體18個(gè)核心基因（atp6 atp8 atp9 cob cox1 cox2 cox3 dpo lagli...
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2022-09-29 分析MTO1_RIP 線粒體RNA的分布針對(duì)上次RIP-MTO1 返回來(lái)的數(shù)據(jù)進(jìn)行分析 1. fastqc 檢查下數(shù)據(jù)質(zhì)量 結(jié)果顯示已去除接頭 2. flash 雙端測(cè)序reads 進(jìn)行拼接 生成了6個(gè)文件 FL...
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線粒體基因組的組裝和注釋（MitoFinder ）
之前有過(guò)用二代測(cè)序的數(shù)據(jù)組裝植物葉綠體基因組昆蟲線粒體的經(jīng)歷摇庙，用的是單位的超算（Linux系統(tǒng)）旱物。 這里的二代測(cè)序數(shù)據(jù)是全基因組的淺層測(cè)序數(shù)據(jù)，因?yàn)槿~綠體和線粒體是多拷貝的卫袒，...
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寫論文：endnote插入文獻(xiàn)從去年開始就已經(jīng)在開始著手寫自己嚴(yán)格意義上的第一篇論文了宵呛，之前的文獻(xiàn)管理軟件用的是Mendeley，覺得也挺好用的夕凝，當(dāng)時(shí)沒(méi)有直接在word中加載插件宝穗，而是在軟件中復(fù)制引用內(nèi)容...
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基因注釋
前情提要 搞NGS，注釋文件是我們經(jīng)常需要用到的码秉。但是不同的實(shí)驗(yàn)室偏愛的數(shù)據(jù)庫(kù)各不相同逮矛，甚至同一個(gè)課題組的小伙伴都會(huì)選擇不同來(lái)源的數(shù)據(jù)庫(kù)。那么不同來(lái)源的數(shù)據(jù)庫(kù)是否有什么不同呢...
