大佬你好!想請(qǐng)教一下vcffilter命令中過濾的AB值代表什么,為什么在vcf文件表頭中沒有說明
關(guān)于SNP的過濾（2）：如何使用vcftools進(jìn)行SNP過濾繼續(xù)上一節(jié)課教程的下半節(jié)，繼續(xù)介紹一些其他過濾SNP的工具，歡迎大家跟著學(xué)習(xí)。 從現(xiàn)在開始，過濾步驟假定vcf文件是由FreeBayes生成的。（但是其他的vcf也是類似的，...
工具背景介紹 D統(tǒng)計(jì)量（也稱為ABBA-BABA統(tǒng)計(jì)量）和相關(guān)統(tǒng)計(jì)量通常用于評(píng)估種群或緊密相關(guān)物種之間的是否存在基因流谤狡。當(dāng)前計(jì)算D統(tǒng)計(jì)量的工具大多數(shù)都需要該工具自定義特定的文...
Tajima's D - Wikipedia[https://en.wikipedia.org/wiki/Tajima%27s_D] Tajima's D是由日本研究員田田文...
原文地址: SNP Filtering Tutorial 感覺文章寫的真棒墓懂，于是就翻譯了一遍 目標(biāo) 學(xué)習(xí)如何使用VCFtools根據(jù)缺失信息焰宣，基因型深度(genotype d...
帶零食來二號(hào)樓411，好好認(rèn)識(shí)一下
群體遺傳筆記（一）：群體間選擇信號(hào)的檢測及GO注釋從獲取下機(jī)數(shù)據(jù)做質(zhì)控捕仔、比對(duì)匕积，到calling snp獲得vcf文件這一步盈罐，網(wǎng)上已經(jīng)有非常詳細(xì)的教程，有GATK4.0和全基因組數(shù)據(jù)分析實(shí)踐（上）闪唆，還有Samtools+bcf...
從獲取下機(jī)數(shù)據(jù)做質(zhì)控盅粪、比對(duì)，到calling snp獲得vcf文件這一步悄蕾，網(wǎng)上已經(jīng)有非常詳細(xì)的教程票顾，有GATK4.0和全基因組數(shù)據(jù)分析實(shí)踐（上），還有Samtools+bcf...
Genotype Imputation是在高通量測序中常出現(xiàn)的定義，按照義譯就是基因型填充番刊。要真正理解imputation這個(gè)概念含鳞，我們就需要先理解基因型缺失（genotyp...
轉(zhuǎn)自：http://www.360doc.com/content/18/0208/11/19913717_728563847.shtml 全基因組重測序是通過對(duì)已有參考序列（...
