一鸭限、暴露因素的數(shù)據(jù)要求： 1.對(duì)于暴露因素的GWAS數(shù)據(jù)，TwoSampleMR需要一個(gè)工具變量數(shù)據(jù)構(gòu)成的data frame两踏，每行對(duì)應(yīng)一個(gè)SNP败京，至少需要4列，分別為： S...
IP屬地：澳門(mén)
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??孟德?tīng)栯S機(jī)化之Exposure data
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多組學(xué)水平的孟德?tīng)栯S機(jī)化分析+three-step SMR 應(yīng)用實(shí)操
多組學(xué)分析：在基因表達(dá)梦染、表觀遺傳赡麦、蛋白、單細(xì)胞及微生物組學(xué)等水平上帕识，利用組學(xué)數(shù)據(jù)比較不同組學(xué)水平的疾病和健康對(duì)照泛粹，從而鑒定潛在的致病機(jī)制。 藥物靶點(diǎn)孟德?tīng)栯S機(jī)化分析：探究是其...
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使用CRISPR/Cas9進(jìn)行基因敲除實(shí)驗(yàn)詳細(xì)步驟解讀protocol
本文是方便查看肮疗，系統(tǒng)整理了凍春卷同學(xué)的教程晶姊。放到一起方便學(xué)習(xí)。原文分散在鏈接：http://www.reibang.com/p/a215be12e3f6[https://w...
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CRISPR-Cas9基因編輯4--確定Cas9質(zhì)粒構(gòu)建成功+漂亮的質(zhì)粒轉(zhuǎn)染簡(jiǎn)介和前期文章 我對(duì)之前的所有教程進(jìn)行了再次詳細(xì)的總結(jié)CRISPR-Cas9基因編輯之背景介紹及gRNA設(shè)計(jì)（上）[http://www.reibang.com/p/e5c...
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Fastq-dump: 一個(gè)神奇的軟件現(xiàn)在可以用fasterq-dump, 速度更快伪货，請(qǐng)閱讀都8102年了们衙，還用fastq-dump，快換fasterq-dump吧 做生信的基本上都跟NCBI-SRA打過(guò)交道,尤...
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Aspera——碾壓prefetch命令的存在, 利用SRR號(hào)批量高效下載FASTQ或SRA數(shù)據(jù)本節(jié)簡(jiǎn)單介紹Aspera安裝和使用碱呼，并給出利用SRR號(hào)批量下載FASTQ或SRA數(shù)據(jù)的方法蒙挑，通過(guò)比較發(fā)現(xiàn)aspera的下載速度與prefetch相比有了質(zhì)的飛躍 前言：我們下...
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單細(xì)胞轉(zhuǎn)錄組數(shù)據(jù)分析|| scanpy教程：PAGA軌跡推斷單細(xì)胞轉(zhuǎn)錄組數(shù)據(jù)分析|| scanpy教程：預(yù)處理與聚類 說(shuō)起軌跡推斷，很多人的第一印象就是monocle的軌跡圖愚臀，大概率是長(zhǎng)這樣子的： 如果說(shuō)單細(xì)胞轉(zhuǎn)錄組數(shù)據(jù)分析中的分群是...
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如何不使用 plot_pseudotime_heatmap畫(huà)出熱圖忆蚀？首先要明白 plot_pseudotime_heatmap的原理，先調(diào)出它的源代碼 根據(jù)上述代碼姑裂，總結(jié)起來(lái)就是馋袜，plot_pseudotime_heatmap=matrix+...
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R 數(shù)據(jù)可視化 —— 聚類熱圖 ComplexHeatmap(一)前言 使用 pheatmap 已經(jīng)能夠繪制滿足大多數(shù)要求的聚類熱圖了。 受 pheatmap 包的啟發(fā)舶斧，ComplexHeatmap 提供了對(duì)熱圖更多更靈活的控制欣鳖，如多數(shù)據(jù)熱...
