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全網(wǎng)最全免疫組庫(kù)分析流程+代碼復(fù)現(xiàn)（一）
免疫組庫(kù)（Immune Repertoire糕殉，IR） 是指?jìng)€(gè)體在某個(gè)特定時(shí)間其循環(huán)系統(tǒng)中所有多樣性的T細(xì)胞和B細(xì)胞的總和晨炕，即V(D)J序列多樣性...
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全網(wǎng)最全免疫組庫(kù)分析流程+代碼復(fù)現(xiàn)（二）
代碼復(fù)現(xiàn)： 1.結(jié)果轉(zhuǎn)換（使用TRUST4恢復(fù)） 因?yàn)門URST4恢復(fù)的結(jié)果不能直接適配vdjtools汇跨，所以需要進(jìn)行列名更改猪狈。示例：樣品分為C...
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【R】單細(xì)胞分析GO KEGG報(bào)錯(cuò)解決方法
Error in download.KEGG.Path(species) : 'species' should be one of organi...
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免疫組庫(kù)多樣性（Richness/Diversity/Clonality）的計(jì)算Calculation of repertoire metrics VDJTOOLS的CalcDiversityStats函數(shù)提供了直接計(jì)算功能...
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免疫組庫(kù)分析實(shí)戰(zhàn)/mixcr+vdjtools+R實(shí)現(xiàn)使用《OncoImmunology》一篇paper中的數(shù)據(jù)進(jìn)行實(shí)戰(zhàn) 數(shù)據(jù)獲取地址：https://www.ncbi.nlm.nih.gov/bi...
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使用vdjtools進(jìn)行免疫組庫(kù)分析mixcr與vdjtools是基于java平臺(tái)開發(fā)的處理從原始序列到定量克隆型的大量免疫組數(shù)據(jù)的免疫分析軟件，在使用前要確保java環(huán)境是ok的...
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使用mixcr構(gòu)建免疫組庫(kù)及下游分析免疫組庫(kù)（Immune Repertoire界阁，IR）是指?jìng)€(gè)體在某個(gè)特定時(shí)間其循環(huán)系統(tǒng)中所有多樣性的T細(xì)胞和B細(xì)胞的總和令漂，即V(D)J序列多樣性的...
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RNA-seq轉(zhuǎn)錄組差異分析及可視化關(guān)于RNAseq Nature重磅綜述 |關(guān)于RNA-seq，你想知道的都在這[https://app.yinxiang.com/fx/f8c7...