
13. 富集氣泡圖繪制 清除當(dāng)前環(huán)境中的變量 設(shè)置工作目錄 讀取示例數(shù)據(jù) 基礎(chǔ)symbols函數(shù)繪制氣泡圖 ggplot2包繪制富集氣泡圖 ggpubr包繪制富集氣泡圖
健明大神說(shuō)過(guò)若是想學(xué)會(huì)使用R包,就去看那個(gè)包的說(shuō)明書(shū),因此去學(xué)習(xí)了GEOquery包說(shuō)明書(shū)。翻譯不當(dāng)之處請(qǐng)去看原文。文章來(lái)源:http://www.bioconductor....
關(guān)于用getGEO下載數(shù)據(jù)后,會(huì)得到一個(gè)list,取出第一個(gè)列表中的元素后拔鹰,再查看這第一個(gè)元素的數(shù)據(jù)類型后,發(fā)現(xiàn)他是一個(gè)對(duì)象("ExpressionSet")贵涵,然后我們就會(huì)用...
進(jìn)行基因差異分析 1.讀取數(shù)據(jù) 2.檢測(cè)數(shù)據(jù) 3.為每個(gè)數(shù)據(jù)集繪制箱形圖列肢,比較數(shù)據(jù)集中的數(shù)據(jù)分布(單一某個(gè)基因分析) 4.對(duì)某種基因在樣本中的表達(dá)情況根據(jù)分組統(tǒng)一分析(所有基...
寫(xiě)在前面: 對(duì)于我們大多數(shù)來(lái)說(shuō)恰画,用圖形或圖表更比數(shù)據(jù)本身更能說(shuō)明問(wèn)題,更容易讓人理解瓷马,并且可以賞心悅目拴还。細(xì)胞內(nèi)部,大量的分子時(shí)刻都在發(fā)生著變化或相互作用欧聘。對(duì)于我們來(lái)說(shuō)片林,了解這...
limma分析差異基因 在經(jīng)過(guò)了前兩期中的數(shù)據(jù)下載,數(shù)據(jù)基本處理之后树瞭,解決了一個(gè)探針對(duì)應(yīng)多個(gè)基因數(shù)的以及多個(gè)探針對(duì)應(yīng)一個(gè)基因求平均值拇厢,在此基礎(chǔ)上運(yùn)用limma包分析差異基因除...
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