發(fā)簡信
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R語言可視化（十三）：氣泡圖繪制13. 富集氣泡圖繪制 清除當(dāng)前環(huán)境中的變量 設(shè)置工作目錄 讀取示例數(shù)據(jù) 基礎(chǔ)symbols函數(shù)繪制氣泡圖 ggplot2包繪制富集氣泡圖 ggpubr包繪制富集氣泡圖
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GEO數(shù)據(jù)挖掘-使用GEOquery包
健明大神說過若是想學(xué)會(huì)使用R包饵筑，就去看那個(gè)包的說明書锅棕，因此去學(xué)習(xí)了GEOquery包說明書层玲。翻譯不當(dāng)之處請(qǐng)去看原文分苇。文章來源：http://www.bioconductor....
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GEO數(shù)據(jù)分析中exprs提取表達(dá)矩陣颠放，pData提取臨床信息
關(guān)于用getGEO下載數(shù)據(jù)后允睹，會(huì)得到一個(gè)list，取出第一個(gè)列表中的元素后幌氮，再查看這第一個(gè)元素的數(shù)據(jù)類型后缭受，發(fā)現(xiàn)他是一個(gè)對(duì)象（"ExpressionSet"），然后我們就會(huì)用...
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R語言GEO數(shù)據(jù)挖掘：步驟三：進(jìn)行基因差異分析進(jìn)行基因差異分析 1.讀取數(shù)據(jù) 2.檢測數(shù)據(jù) 3.為每個(gè)數(shù)據(jù)集繪制箱形圖该互，比較數(shù)據(jù)集中的數(shù)據(jù)分布（單一某個(gè)基因分析） 4.對(duì)某種基因在樣本中的表達(dá)情況根據(jù)分組統(tǒng)一分析（所有基...
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Cytoscape中文教程（1）寫在前面： 對(duì)于我們大多數(shù)來說喂分，用圖形或圖表更比數(shù)據(jù)本身更能說明問題，更容易讓人理解机蔗，并且可以賞心悅目蒲祈。細(xì)胞內(nèi)部，大量的分子時(shí)刻都在發(fā)生著變化或相互作用萝嘁。對(duì)于我們來說梆掸，了解這...
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R語言GEO數(shù)據(jù)挖掘03-limma分析差異基因limma分析差異基因 在經(jīng)過了前兩期中的數(shù)據(jù)下載沥潭，數(shù)據(jù)基本處理之后，解決了一個(gè)探針對(duì)應(yīng)多個(gè)基因數(shù)的以及多個(gè)探針對(duì)應(yīng)一個(gè)基因求平均值嬉挡，在此基礎(chǔ)上運(yùn)用limma包分析差異基因除...
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公眾號(hào): 醫(yī)科研<br>wechat: YKY7060
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如何用人工智能幫你找論文庞钢？傳統(tǒng)的關(guān)鍵詞檢索論文拔恰，浩如煙海的結(jié)果讓你無所適從？試試人工智能檢索引擎基括。根據(jù)你的研究興趣和偏好颜懊，便捷而靠譜幫你找論文。 煩惱 進(jìn)入一個(gè)新領(lǐng)域风皿，讀論文是必然途徑河爹。 讀者一般會(huì)遇...
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終身學(xué)習(xí)者咸这、大學(xué)教師。稍微懂一點(diǎn)兒寫作魔眨、演講媳维、Python和機(jī)器學(xué)習(xí)酿雪。歡迎微信關(guān)注并置頂我的公眾號(hào)“玉樹芝蘭”(nkwangshuyi)。我已委托“維權(quán)騎士”（rightknights.com）為我的文章進(jìn)行維權(quán)行動(dòng)侄刽。
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MSKCC Research Associate<br>別趕不上野心州丹，又辜負(fù)了努力
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GEO數(shù)據(jù)庫視頻學(xué)習(xí)筆記（差異分析醋安、可視化、GSEA）筆記回顧：1.GEO數(shù)據(jù)庫視頻學(xué)習(xí)筆記（芯片數(shù)據(jù)下載和數(shù)據(jù)讀鹊卑取）2.GEO數(shù)據(jù)庫視頻學(xué)習(xí)筆記（ID轉(zhuǎn)換）3.GEO數(shù)據(jù)庫視頻學(xué)習(xí)筆記（了解你的表達(dá)矩陣） 這一講的視頻地址是：...
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生物信息學(xué)操作基礎(chǔ)（一）對(duì)于學(xué)習(xí)生物的專業(yè)的同學(xué)入門生物信息學(xué)茬故，門檻之一可能是計(jì)算機(jī)操作。這篇隨筆會(huì)簡單介紹一些最基本的概念和操作蚁鳖，盡量幫助同學(xué)們繞過非專業(yè)方面的一些門檻磺芭。ps:本人水平十分有限，且...
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