寫在前面 熱圖挂据,或稱熱力圖,是外文 Heatmap 的直譯儿普。在幾乎所有數(shù)值分析相關(guān)工作中都可以看到崎逃。生物信息學(xué)數(shù)據(jù),自然躲不過眉孩。無(wú)論是形態(tài)數(shù)據(jù)个绍,還是基因拷貝數(shù)數(shù)據(jù),或是基因表...
1浪汪,人類所有基因蛋白序列下載 數(shù)據(jù)庫(kù)地址:https://www.uniprot.org/tool-dashboard[https://www.uniprot.org/too...
@小小_4dbf 謝謝建議
安裝R包 x86_64-conda_cos6-linux-gnu/bin/ld: cannot find -lxxx 問題解決問題 安裝R包(ade4)時(shí)遇到以下問題(缺少庫(kù)文件): 從報(bào)錯(cuò)信息可以看出報(bào)錯(cuò)根本原因是找不到lapack和blas庫(kù)(-l 是lib的意思巴柿,xxx是庫(kù)名) 問題解決: 1...
@小小_4dbf 謝謝補(bǔ)充
安裝R包 x86_64-conda_cos6-linux-gnu/bin/ld: cannot find -lxxx 問題解決問題 安裝R包(ade4)時(shí)遇到以下問題(缺少庫(kù)文件): 從報(bào)錯(cuò)信息可以看出報(bào)錯(cuò)根本原因是找不到lapack和blas庫(kù)(-l 是lib的意思,xxx是庫(kù)名) 問題解決: 1...
@jerry_2018 已發(fā)死遭,查收
maftools畫棒棒糖圖 (Lollipop chart)-基因突變可視化maftools是一個(gè)很強(qiáng)大的R語(yǔ)言可視化包广恢,上篇“maftools畫瀑布圖(oncoplot)”(http://www.reibang.com/p/6cccf7c4bb0...
1,散點(diǎn)圖 結(jié)果示例: 輸入文件示例: 代碼: 2殃姓,散點(diǎn)圖+擬合曲線+折線圖 結(jié)果示例: 輸入文件示例: 代碼: 3袁波,散點(diǎn)圖+擬合曲線+部分點(diǎn)標(biāo)注 結(jié)果示例: 輸入文件示例:...
表示p值顯著性。NS:表示不顯著(P>0.05)蜗侈;*表示P<=0.05;**表示P<=0.01;***表示P<=0.001;****表示P<=0.0001
配對(duì)數(shù)據(jù)wilcox.test檢驗(yàn)及可視化用途 配對(duì)樣本秩和檢驗(yàn)及可視化(箱線圖) 代碼 加載包 第一組數(shù)據(jù)檢驗(yàn)及畫圖(不單獨(dú)生成圖片) 第2/3/4/5/6組數(shù)據(jù)檢驗(yàn)及畫圖 把多個(gè)圖片組合到一起 方法1: 方法2:...
定義 Pearson's chi squared test: Pearson卡方檢驗(yàn)踏幻,由著名統(tǒng)計(jì)學(xué)家Karl Pearson提出枷颊,主要是比較兩個(gè)及兩個(gè)以上樣本構(gòu)成比以及兩個(gè)分...
為什么要進(jìn)行數(shù)據(jù)過濾 二代測(cè)序的下機(jī)數(shù)據(jù)經(jīng)堿基識(shí)別得到的原始序列稱為raw-data羹令。raw-data中可能含有接頭(adapter)、低質(zhì)量序列及N序列(N 表示無(wú)法確定堿...
tags: Trimmomatic NGS fastq NGS 原始數(shù)據(jù)過濾對(duì)后續(xù)分析至關(guān)重要损痰,去除一些無(wú)用的序列也可以提高后續(xù)分析的準(zhǔn)確率和效率特恬。Trimmomatic 是...
問題 安裝R包(seqinr)時(shí)遇到以下問題(缺少config文件): 從報(bào)錯(cuò)信息可以看出報(bào)錯(cuò)根本原因是找不到zlib.h 問題解決: 1,確認(rèn)是否安裝zlib 注:上述命令...
問題 安裝R包(ade4)時(shí)遇到以下問題(缺少庫(kù)文件): 從報(bào)錯(cuò)信息可以看出報(bào)錯(cuò)根本原因是找不到lapack和blas庫(kù)(-l 是lib的意思徐钠,xxx是庫(kù)名) 問題解決: 1...
@熊歪歪 已發(fā)癌刽,查收。
maftools畫棒棒糖圖 (Lollipop chart)-基因突變可視化maftools是一個(gè)很強(qiáng)大的R語(yǔ)言可視化包尝丐,上篇“maftools畫瀑布圖(oncoplot)”(http://www.reibang.com/p/6cccf7c4bb0...
產(chǎn)生原因 anaconda下安裝的R显拜,R目錄下的/安裝目錄/bin/software/anaconda/lib/R/etc/Makeconf為空 解決版本 1,確定R安裝路徑...