共病遺傳（或稱異病同根）怔蚌，我們對疾病的認(rèn)識從回溯至遺傳學(xué)根源的那一刻起就已經(jīng)進(jìn)入了另一個新的里程议忽。 今天我想分享一篇今年9月24日發(fā)表于 《Nature communicat...
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共病遺傳的研究方法：關(guān)于多發(fā)性硬化癥和炎癥性腸炎遺傳共病研究的例子 -
表達(dá)數(shù)量性狀位點(diǎn)（eQTL）的概念及其相關(guān)分析
表達(dá)數(shù)量性狀位點(diǎn)（expression quantitative trait locus, eQTL）是一類能夠影響基因表達(dá)量的遺傳位點(diǎn)（大部分都是單核苷酸多態(tài)性，SNP）腥例，...
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2020-05-04 eigenMT
eigenMT：解釋變異間連鎖不平衡的eQTL研究的有效多重檢驗調(diào)整 簡介 特征最小二乘法是順式eQTL研究中一種計算效率較高的多重檢驗校正方法。通常永罚，現(xiàn)代順式eQTL研究可...
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使用OSCA進(jìn)行eQTL分析Nathan寫于20200807悯森。OSCA（OmicS-data-based Complex trait Analysis）是楊老師2019年發(fā)表的用于分析多組學(xué)數(shù)據(jù)復(fù)雜性狀...
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單細(xì)胞轉(zhuǎn)錄組測序中的降維和聚類前言 在以往常規(guī)轉(zhuǎn)錄組測序中，由于實(shí)驗生物學(xué)重復(fù)巷怜，同組內(nèi)測序得到的數(shù)據(jù)是接近的葛超，通過簡單的線性降維PCA主成分分析法，即可得到想要的可視化結(jié)果（組內(nèi)樣本聚集延塑，組間樣本分離）绣张。...
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清明節(jié)后第一天從畫一張圖開始今天我們的任務(wù)就是復(fù)現(xiàn)一張圖，如下： 來吧关带，這個圖的復(fù)現(xiàn)不見得簡單侥涵，不信大家可以嘗試一下： 首先來學(xué)習(xí)一下ggrepel包 用法是geom_text(label)_repel...
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單細(xì)胞之軌跡分析-2：monocle2 原理解讀+實(shí)操軌跡分析系列： 單細(xì)胞之軌跡分析-1：RNA velocity[http://www.reibang.com/p/ee0f7a8e6a06] 擬時間序列分析（Pseudot...
