240 發(fā)簡(jiǎn)信
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    我的GWAS高級(jí)曼哈頓圖折騰過程

    如果說別人畫圖是折騰自己,那我畫圖可能就是折騰自己兼折騰群主.......首先在這里感謝何大哥哈(知乎:hewm2008)、很耐心的為我解答了許...

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    生物信息數(shù)據(jù)質(zhì)控詳解(全基因組)第一輯

    目標(biāo) 全基因組關(guān)聯(lián)研究 (GWAS) 在鑒定單核苷酸多態(tài)性 (SNP) 和表型特征之間的關(guān)聯(lián)方面變得越來越流行气堕。GWAS 方法通常應(yīng)用于社會(huì)科學(xué)...

  • pi分析

    單個(gè)群體的基因組選擇信號(hào)分析(pi分析) Pi值 Tajima D; Pi主要用來衡量每個(gè)site的nucleotide divergency....

  • fst計(jì)算

    FST分析 首先將plink文件轉(zhuǎn)化成VCF文件(轉(zhuǎn)換方法見plink章)準(zhǔn)備兩個(gè)種群文件sample1andsample2 sample1代表...

  • plink參考

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  • snp曼哈頓圖繪制

    使用CMplot包繪制環(huán)形曼哈度圖 安裝并加載所需R包 基本用法 常用參數(shù) 加載并查看示數(shù)據(jù) 基本數(shù)據(jù)格式: 默認(rèn)繪圖(分別繪制出SNP密度圖君珠,...

  • 生物信息基礎(chǔ)

    生物信息基礎(chǔ)(計(jì)算機(jī)方面) by張成龍 此篇為開篇椭坚,大多為自己總結(jié)和參考老劉的老本 PLINK文件格式 自從plink更新到1.9/2.0以后媚媒,...

  • 經(jīng)典突觸的傳遞過程

    突觸:由突觸前膜锄码,突觸間隙触徐,突觸后膜組成 當(dāng)突觸前神經(jīng)元興奮傳到神經(jīng)末梢時(shí)咪鲜,突觸前膜去極化,電壓門控Ca2+通道開放撞鹉,對(duì)Ca2+通透性增強(qiáng)疟丙,Ca...

  • 經(jīng)典突觸的生物原理與生物特點(diǎn)

    生物原理 突觸(synapse):兩個(gè)神經(jīng)元之間或神經(jīng)元與效應(yīng)器細(xì)胞之間相互接觸、并借以傳遞信息的部位鸟雏。突觸一詞首先由英國(guó)神經(jīng)生理學(xué)家C.S.謝...

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