感覺100年沒有上簡書脸甘，近2個月忙于畢業(yè)論文以及公眾號推文，沒有時間更文章喷面。終于前幾天交了論文呢星瘾，可以回來更文了。沒錯我只是在為我的懶惰尋找接口惧辈，今天我們來講一下闪兆矗基圖（Sa...
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R數據可視化17:擅背牛基圖 -
R: ggtree (一) base導讀 ggtree由R語言大神Y叔紙筆，于2018年發(fā)表在Molecular Biology and Evolution雜志上盒齿，現引用已達407（2019.10.10 goo...
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KEGG數據庫：查找某個通路上的所有基因
1.kegg數據庫下載 通常我們如果已知某個基因念逞，想對這個基因做通路很簡單，直接用kegg的網頁注釋就可以边翁；如果想知道某個通路里相關的所有基因列表翎承，要找全的話只能從數據庫里調...
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從TCGA數據庫下載并整合清洗高通量腫瘤表達譜-臨床性狀數據測序上游分析系列： mRNA-seq轉錄組二代測序從raw reads到表達矩陣：上中游分析pipelinemiRNA-seq小RNA高通量測序pipeline：從raw r...
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TCGA數據整合后進行DESeq2差異表達分析和基于R的多種可視化測序上游分析系列： mRNA-seq轉錄組二代測序從raw reads到表達矩陣：上中游分析pipelinemiRNA-seq小RNA高通量測序pipeline：從raw r...
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小鼠基因集-GSKB--R進行GSEA富集分析1. 數據集介紹 ??由于人類基因集富集分析，有msigdb數據庫[https://www.gsea-msigdb.org/gsea/downloads.jsp]倒彰，上面有各種...
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TCGA轉錄組差異分析后多種基因功能富集分析：從GO/KEGG到GSEA和GSVA/ssGSEA（含基因ID轉換）測序上游分析系列： mRNA-seq轉錄組二代測序從raw reads到表達矩陣：上中游分析pipelinemiRNA-seq小RNA高通量測序pipeline：從raw r...
