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多序列比對（Multiple Sequence Alignment市栗，簡稱 MSA）大家應(yīng)該都不陌生了吧乔煞！這是用于比較多個序列相似性和差異性的常用分析方法颊乘。 在 Linux 系...

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學(xué)習(xí)GO富集分析 一色查、準(zhǔn)備 如果想安裝動物的數(shù)據(jù)庫可以用OrgDB數(shù)據(jù)庫掸茅，其中包含了19個模式物種對應(yīng)的全基因組注釋R包藕咏，方便直接根據(jù)物種基因ID進(jìn)行GO役耕，KEGG注釋分析等...

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跑一遍 一缩赛、數(shù)據(jù)準(zhǔn)備和讀取 擬南芥數(shù)據(jù) 二耙箍、數(shù)據(jù)處理 三、可視化 1酥馍、氣泡圖 2辩昆、柱形圖 今天就不介紹圖形了，就跑個完整代碼~下次出專門介紹各種圖的旨袒。 生物信息學(xué)領(lǐng)域非常廣泛...

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一汁针、力導(dǎo)向布局（Force-directed Layout）： 力導(dǎo)向布局可以通過模擬物理力（例如斥力和引力）來擺放節(jié)點，使得相互作用較強(qiáng)的蛋白質(zhì)會被拉得更近砚尽，反之則相隔更遠(yuǎn)...

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SNP密度圖是一種常用的遺傳學(xué)數(shù)據(jù)可視化工具施无，主要用于直觀展示單核苷酸多態(tài)性（SNP）在基因組上的分布密度。 通過該圖尉辑，研究者可以有效地分析SNP在不同染色體或基因組區(qū)域的分...

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一隧魄、文獻(xiàn) WGCNA（Weighted Gene Co-expression Network Analysis卓练，加權(quán)基因共表達(dá)網(wǎng)絡(luò)分析）是一種用于挖掘高維基因表達(dá)數(shù)據(jù)的系統(tǒng)生...

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這是我看別人數(shù)據(jù)畫的，比一般的火山圖好看购啄，那我們用上次的數(shù)據(jù)試一下襟企。 1、上代碼狮含，簡單處理一下數(shù)據(jù)即可繪圖 2顽悼、出圖（代碼正常運(yùn)行，數(shù)據(jù)自己調(diào)整啦~） 3几迄、完畢 生物信息學(xué)領(lǐng)...

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在生物學(xué)和植物學(xué)研究中蔚龙，地圖作為展示物種分布、分析生態(tài)環(huán)境關(guān)系以及追蹤動態(tài)變化的重要工具映胁，具有不可或缺的作用木羹。 通過地圖，研究人員能夠直觀地呈現(xiàn)植物物種的地理分布范圍，深入探...

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有的 R 包可能要求一個更高版本的 R 才能安裝或正常工作坑填，所以先安裝或者更新R抛人，來更輕松地安裝并使用最新的 R 包。 一脐瑰、 1. 更新 R 到更高版本 ① 在 Ubuntu...