1.課程回顧 例1：房?jī)r(jià)和面積—預(yù)測(cè) 給定一組房?jī)r(jià)和房屋面積的數(shù)據(jù)集，通過(guò)機(jī)器學(xué)習(xí)算法(監(jiān)督學(xué)習(xí))來(lái)擬合畫(huà)出一條線娩践，根據(jù)這條線來(lái)對(duì)未知的數(shù)據(jù)進(jìn)行判斷威蕉。 假設(shè)機(jī)器通過(guò)這些房?jī)r(jià)數(shù)...
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【吳恩達(dá)機(jī)器學(xué)習(xí)】第一周—單變量線性回歸 -
文章同步發(fā)表在：<br>1.公眾號(hào)：SunFlow007<br>2.知乎：Lyon<br><a href="https://links.jianshu.com/go?to=https%3A%2F%2Fwww.zhihu.com%2Fpeople%2Fbetter-man007%2Fcolumns" target="_blank">https://www.zhihu.com/people/better-man007/columns</a><br>
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研究生一枚，主要研究方向?yàn)橹参飪?nèi)生菌及微生物相關(guān)內(nèi)容窥翩，公眾號(hào)【科研后花園】业岁，主要更新內(nèi)容：1）基于R的科研繪圖；2）科研小技巧分享寇蚊；3）繪圖技巧分享笔时；4）科研網(wǎng)站分享。
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跟著Nature Communication學(xué)數(shù)據(jù)分析：R語(yǔ)言利用宏基因組的相對(duì)豐度數(shù)據(jù)做主坐標(biāo)分析（PcoA)）論文 Microbiomes in the Challenger Deep slope and bottom-axis sediments https://www.natur...
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宏基因組 + 宏轉(zhuǎn)錄組分析工具：HUMAnN導(dǎo)讀 HUMAnN（全稱(chēng)HMP Unified Metabolic Analysis Network）最早由Curtis Huttenhower團(tuán)隊(duì)針對(duì)HMP項(xiàng)目開(kāi)發(fā)的一款可...
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MGCA：微生物基因組組分與注釋管道MGCA Microbial genome component and annotation pipeline Introduction The software under...
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CAZy碳水化合物活性酶預(yù)測(cè)CAZy數(shù)據(jù)庫(kù)簡(jiǎn)介 CAZy 全稱(chēng)為Carbohydrate-Active enZYmes Database允耿，碳水化合物酶相關(guān)的專(zhuān)業(yè)數(shù)據(jù)庫(kù)，內(nèi)容包括能催化碳水化合物降解扒怖、修飾...
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PGCGAP v1.0.35版本更新
PGCGAP 是用于原核生物基因組學(xué)和比較基因組學(xué)分析管道较锡，目前該管道包含 12 個(gè)模塊，可以接受 Illumina 雙端 reads盗痒、Oxford reads 或 PacB...
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利用PGCGAP根據(jù)ids提利用PGCGAP根據(jù)id提取序列信息
使用場(chǎng)景 假設(shè)有一個(gè) fasta 格式的序列文件SRR9620252.faa蚂蕴，我們想要提取其中的一些序列到一個(gè)新的文件中，我們擁有這些序列的 id （假設(shè)這些 id 存放在文...
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Cannot connect to the Docker daemon at tcp://localhost:2375. Is the docker daemon running?
docker本地默認(rèn)是unix socket俯邓，這里報(bào)錯(cuò)是使用了tcp骡楼，默認(rèn)情況下，Unix的socket屬于用戶root看成，其它用戶要使用要通過(guò)sudo命令君编。由于這個(gè)原因跨嘉，do...
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@朱橘橘 現(xiàn)在一般都不用虛擬機(jī)了川慌，Bio-linux應(yīng)該也是多年未更新了吧。如果是WIN10系統(tǒng)祠乃，可以直接安裝WSL梦重，自己裝軟件×链桑可參考我的另一篇文章琴拧，有視頻教程（https://protocolexchange.researchsquare.com/article/pex-807/v5）
生物信息學(xué)1：虛擬機(jī) & Bio-linux安裝與配置
前言：大家按照步驟從頭看到尾，末尾有常見(jiàn)錯(cuò)誤解決辦法嘱支，如果有其他問(wèn)題蚓胸，大家先看錯(cuò)誤提示挣饥，根據(jù)提示自行百度，很多問(wèn)題都可以得到解決沛膳，實(shí)在解決不了的可以問(wèn)我扔枫，謝謝！找我遠(yuǎn)程的锹安，先...
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主程序就是壓縮包里的“kSNP3”文件短荐，可以用任何文本編輯器打開(kāi)，還有問(wèn)題可加群“生信之巔”
kSNP3尋找SNPs并構(gòu)建進(jìn)化樹(shù)
1. kSNP3 安裝 cd ~/toolswgethttps://sourceforge.net/projects/ksnp/files/kSNP3.1_Linux_pac...
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R繪圖腳本(python等繪圖腳本)自適應(yīng)圖片大小的方法(plot ggplot png pdfggsave等)問(wèn)題與適用性描述 繪圖的時(shí)候一般是默認(rèn)圖背景大小或指定大小叹哭，但是多數(shù)圖片需要展示的內(nèi)容不是固定的忍宋，兩種方法都會(huì)導(dǎo)致圖片過(guò)大或過(guò)小，解決方法是根據(jù)圖片內(nèi)容自動(dòng)設(shè)置背景大小风罩，這里...
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公眾號(hào) R語(yǔ)言數(shù)據(jù)分析指南研乒，歡迎大家關(guān)注
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ggplot2優(yōu)雅的繪制高端熱圖本節(jié)來(lái)介紹如何通過(guò)ggplot2繪制復(fù)雜熱圖 加載R包 加載數(shù)據(jù) 數(shù)據(jù)清洗 繪制熱圖 ggtree繪制聚類(lèi)樹(shù) 繪制樣本分類(lèi)色條 基因長(zhǎng)度信息可視化 基因平均表達(dá)量可視化 展示...
