學(xué)生
發(fā)簡(jiǎn)信
IP屬地：天津
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麥吉爾大學(xué)碩士, 專(zhuān)注個(gè)人成長(zhǎng)
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細(xì)菌全基因組測(cè)序數(shù)據(jù)構(gòu)建SNP系統(tǒng)發(fā)育樹(shù)
本次分析使用到的數(shù)據(jù)及數(shù)據(jù)處理流程參考文獻(xiàn)“https://doi.org/10.1186/s13756-018-0352-y[https://doi.org/10.1186...
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4?? 核酸序列特征分析(1):開(kāi)放閱讀框識(shí)別序列比對(duì)和序列特征分析總目錄 閱讀框Open Reading Frame，ORF ORF指的是DNA上的序列祟牲，從5'端翻譯起始密碼子ATG到終止密碼子(TAA,TAG,TGA...
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4?? 核酸序列特征分析(4):內(nèi)含子/外顯子剪切位點(diǎn)的識(shí)別真核生物的基因大都為斷裂基因隙畜，編碼序列通常被內(nèi)含子隔開(kāi)。內(nèi)含子和外顯子邊界和周?chē)蛄惺乔绑wmRNA內(nèi)的有保守性的一些特殊核苷酸序列说贝。 內(nèi)含子的5'端剪切位點(diǎn)以GU開(kāi)始议惰，叫do...
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CSC聯(lián)合培養(yǎng)博士經(jīng)驗(yàn)分享（一）：聯(lián)系學(xué)校篇前 言 在美國(guó)已將近2個(gè)月了言询，目前一切都挺滿(mǎn)意的，趁著周末時(shí)間（拖延癥啊~~本該2個(gè)月前要寫(xiě)好的）記錄下自己申請(qǐng)CSC公派聯(lián)合培養(yǎng)歷程傲宜，恰好10月份正是申請(qǐng)的黃金時(shí)節(jié)运杭，所以希...
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CD-hit安裝及使用
cd-hit是用于蛋白質(zhì)序列或核酸序列聚類(lèi)的工具彤钟，根據(jù)序列的相似度對(duì)序列進(jìn)行聚類(lèi)以去除冗余的序列，一般用于構(gòu)建非冗余的數(shù)據(jù)集用于后續(xù)的實(shí)驗(yàn)分析跷叉。 cd-hit聚類(lèi)算法 通常來(lái)...
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進(jìn)化樹(shù)+蛋白結(jié)構(gòu)域目標(biāo) 數(shù)據(jù)準(zhǔn)備 依然查看help界面的Protein domains 在上傳數(shù)據(jù)的時(shí)候我們發(fā)現(xiàn)多了按鈕帖世，可以從PFAM上上傳數(shù)據(jù)休蟹，evolview使用的標(biāo)簽名必須與PFAM的...
