前言 1.1948 年朋截，香農(nóng)提出了“信息熵”(shāng)； 2.信息量的度量就等于不確定性的多少。即：要搞懂一個(gè)非常非常不確定（gaoleng）的女孩（或是說我們一無所知的...
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如何使用R計(jì)算香農(nóng)熵？ -
貝葉斯共定位軟件coloc前言 這篇文章的書寫名眉，是受啟發(fā)于《post-GWAS：使用coloc進(jìn)行共定位分析(Colocalization)》壤追，目的是想了解一下軟件coloc是如何巧妙的運(yùn)用貝葉斯方法...
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R包MetaboAnalystR安裝指南（Linux環(huán)境非root）前言 這是代謝組學(xué)數(shù)據(jù)分析的一個(gè)R包，包括用于代謝組學(xué)數(shù)據(jù)分析示弓、可視化和功能注釋等眾多功能讳侨。最近有同事在集群中搭建蛋白和代謝流程，安裝這個(gè)包出現(xiàn)了問題避乏，于是我折騰了一上午爷耀。 ...
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scRNA-Seq | Seurat 安裝和輸入數(shù)據(jù)類型
一、安裝及載入 1.直接安裝 BiocManager 安裝 devtools 安裝 conda 安裝如果上述步驟嘗試不可行拍皮，請(qǐng)嘗試下面方法用 conda 安裝 R 及 Seu...
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黃金簡(jiǎn)史：從最初到最后導(dǎo)讀 今年一季度金價(jià)飆升超過13%歹叮，全球最大的黃金ETF SPDR Gold持金量在二季度增加了211.9噸，增幅接近22%铆帽，這反映出投資者對(duì)黃金的高需求咆耿。 黃金，折射出人世...
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中文文本標(biāo)注工具調(diào)研以及BRAT安裝使用背景：最近的工作需要對(duì)文本先進(jìn)行標(biāo)注爹橱，然后才可以做接下來的文本分類工作萨螺。其中主要內(nèi)容是對(duì)一段文本打標(biāo)簽，標(biāo)記該文本描述了一個(gè)我們預(yù)定義的種類標(biāo)簽愧驱。 原來文本數(shù)量少的時(shí)候可以手...
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單體型圖譜簡(jiǎn)介（1）單體型概念及起源 單體型的概念 一個(gè)染色體區(qū)域中所有相關(guān)聯(lián)的SNP等位基因的集合或位于染色體上某一區(qū)域的一組相關(guān)聯(lián)的SNP等位位點(diǎn)被稱為一個(gè)單體(haplotype)慰技。 如：...
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如何將Bert句向量應(yīng)用于深度神經(jīng)網(wǎng)絡(luò)中
Bert開源了預(yù)訓(xùn)練的中文模型,如果你想直接使用Bert模型生成句子向量(當(dāng)做一個(gè)黑盒),并用于深度學(xué)習(xí)模型中,本文將給出一個(gè)作者親自實(shí)踐的實(shí)例.本文內(nèi)容只針對(duì)于實(shí)踐,并不會(huì)...
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命名實(shí)體識(shí)別不只有BiLSTM+CRF
最近做命名實(shí)體識(shí)別（NER）的任務(wù)比較多，也剛剛接觸NER不久组砚，做一下小小的總結(jié)吻商。近兩年中文命名實(shí)體識(shí)別在信息抽取和關(guān)系抽取上的應(yīng)用受到了研究人員的廣泛關(guān)注，很多比賽也以NE...
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“Every day I remind myself that my inner and outer life are based on the labors of other men, living and dead, and that I must exert myself in order to give in the same measure as I have received and am still receiving.”Quote by Albert Einstein.