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十節(jié)課唁盏，BRIG軟件帶你玩轉(zhuǎn)比較基因組圈圖 -
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聚焦電腦知識與互聯(lián)網(wǎng)那些事i
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用Excel制作三維立體地圖效果咖驮，超詳細(xì)制作過程边器，1分鐘學(xué)會
Excel作為一款強(qiáng)大的數(shù)據(jù)處理辦公應(yīng)用已經(jīng)深受大家的喜愛，它除了基礎(chǔ)的計算功能之外還擁有其它一些強(qiáng)大的功能游沿，比如編程（宏）饰抒、圖片處理等。有人說“Excel除了不能生孩子诀黍，什...
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基因組注釋理論基礎(chǔ)
基因組注釋主要包括四個方面： 重復(fù)序列識別 序列比對方法 RepeatScout袋坑、LTR-finder、Tendem Repeat Finder眯勾、Piler枣宫、Repe...
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基因組注釋之從頭預(yù)測1.創(chuàng)建本地BLAST數(shù)據(jù)庫 使用makeblastdb程序，對上述FASTA格式的蛋白 質(zhì)序列進(jìn)行處理吃环，建立本地BLAST數(shù)據(jù)庫也颤。makeblastdb -in ./uni...
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2020-05-29 學(xué)習(xí)R語言批量爬取NCBI基因注釋數(shù)據(jù)python爬蟲的教程那么多，有些雜亂郁轻，學(xué)習(xí)了2周好多基礎(chǔ)知識還不清楚翅娶，但是我學(xué)習(xí)的目的還是為了用起來，很多學(xué)習(xí)也是沒有必要的好唯，那就學(xué)點實用的吧竭沫。 本來在學(xué)習(xí)利用seleni...
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宏基因組分析流程分析內(nèi)容如下圖所示： 具體分析步驟如下： 數(shù)據(jù)質(zhì)控，使用 kneaddata 軟件骑篙， 該軟件先調(diào)用 Trimmomatic 過濾數(shù)據(jù)蜕提，然后利用 bowtie2 或 bmtag...
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宏基因組組裝：從what 到how宏基因組分析教程microPITA | 宏基因組測序前，你可以這樣篩選樣本 microPITA 加拿大安大略研究所建立的生物信息網(wǎng) 1. 什么是 組裝靶端？ 基因組測序時將測得的...
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周運來杨名，男脏榆，長大了才會遇到的帥哥，穩(wěn)健台谍，瀟灑姐霍，大方，靠譜。一段生信緣镊折，一棵技能樹胯府。生信技能樹核心成員，單細(xì)胞天地供稿人恨胚，簡書創(chuàng)作者骂因，單細(xì)胞數(shù)據(jù)科學(xué)家。
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基因組學(xué)系列專欄大家好赃泡！我是Honglei寒波，歡迎大家來到基因組學(xué)系列專欄！ 從本篇開始升熊，我將分成17篇文章為大家介紹關(guān)于基因組學(xué)的以下方面內(nèi)容： 基因組學(xué)簡介(Introduction to...
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「三代組裝」使用Pilon對基因組進(jìn)行polish
軟件安裝 官方提供了編譯好的jar包俄烁，方便使用 如果要順利運行程序，要求JAVA > 1.7, 以及根據(jù)基因組大小而定的內(nèi)存级野，一般而言是1M大小的基因?qū)?yīng)1GB的內(nèi)存页屠。 總覽...
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