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這次跟著課程（Smartseq2 scRNA小鼠發(fā)育學(xué)習(xí)筆記-1-前言及上游介紹）要練習(xí)的文章是：Dissecting Cell Lineage Specification ...

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文獻(xiàn)：Tau accumulation in astrocytes of the dentate gyrus induces neuronal dysfunction and...

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標(biāo)題：Plasticity of ether lipids promotes ferroptosis susceptibility and evasion來(lái)源：nature ...

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在加載xlsx包的時(shí)候出現(xiàn)了這個(gè)報(bào)錯(cuò)徙硅，查詢后發(fā)現(xiàn)是java的問(wèn)題，需要安裝并配置java環(huán)境搞疗。 參考教程：https://www.runoob.com/java/java-e...

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文獻(xiàn)標(biāo)題：Ferroptosis occurs through an osmotic mechanism and propagates independently of ce...

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文獻(xiàn)標(biāo)題：The innate immunity protein IFITM3 modulates γ-secretase in Alzheimer’s disease雜志：...

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標(biāo)題：Lymph protects metastasizing melanoma cells from ferroptosis雜志：nature 概述 腫瘤可以通過(guò)淋巴和血液...

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前言 從兩個(gè)月前老板說(shuō)要搞一個(gè)簡(jiǎn)單的生信分析到現(xiàn)在休吠，經(jīng)過(guò)一個(gè)轉(zhuǎn)錄組分析的訓(xùn)練后扳埂，感覺(jué)可以試試看了。這個(gè)項(xiàng)目的要求是從一個(gè)單細(xì)胞數(shù)據(jù)里比較不同細(xì)胞在不同通路上轉(zhuǎn)錄水平的差異瘤礁。同...

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直接上操作吧 然后就可以畫(huà)圖了柜思，我們這里用ego_bp來(lái)畫(huà) 目前就先寫到GO吧岩调。匆匆學(xué)習(xí)終究還是只得皮毛，權(quán)做日后復(fù)習(xí)只用赡盘，希望日后繼續(xù)把這個(gè)坑填完

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我們已經(jīng)得到了一個(gè)表達(dá)矩陣号枕，下面我們就用DEseq2篩選差異表達(dá)基因，并進(jìn)行簡(jiǎn)單的visulization陨享。 DESeq流程 第一步我們需要準(zhǔn)備兩個(gè)表葱淳，借用Y大寬姐姐的圖來(lái)說(shuō)...

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到這里我們移師R，由于R是一個(gè)可視化的軟件抛姑，我們下載Windows版的R就好了赞厕。這里我們講一講一些必要R包的安裝，最后把上一步的表達(dá)矩陣做一個(gè)合并（這一步用excel也可以）...

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這里算是正式進(jìn)入了RNA-seq的數(shù)據(jù)分析階段。第一個(gè)工序是序列比對(duì)诲侮。比對(duì)的基本原理就是將打斷后的read回貼到index上镀虐。具體理論部分參考https://www.jian...