翻譯自:http://www.sthda.com/english/wiki/cox-proportional-hazards-model[http://www.sthda.c...
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作者:白介素2相關(guān)閱讀:[R語(yǔ)言生存分析03-Cox比例風(fēng)險(xiǎn)模型]R語(yǔ)言生存分析-02-ggforestR語(yǔ)言生存分析-01ggpubr-專為學(xué)術(shù)繪圖而生(二)ggstats...
@歐陽(yáng)松 好的,謝謝解答
R做GSEA富集分析首先感謝Y叔的clusterprofiler神包挚歧,做富集分析優(yōu)點(diǎn)是在線爬取數(shù)據(jù)岩喷,結(jié)果很可信峰尝,但是缺點(diǎn)也是網(wǎng)絡(luò)問(wèn)題庆冕,網(wǎng)絡(luò)差點(diǎn)就要等很久惰许,不過(guò)GSEA有自帶GMT文件展懈,因此下載好...
在ncbi上搜索 kegg && Kanehisa M,這個(gè)作者簡(jiǎn)直不要太牛了哦幌陕,就一個(gè)KEGG數(shù)據(jù)庫(kù)诵姜,發(fā)了好多文章啊,目前KEGG有18個(gè)數(shù)據(jù)庫(kù)搏熄,每一個(gè)數(shù)據(jù)庫(kù)一篇的話棚唆,呵呵...
題目出自【生信技能樹】公眾號(hào)文章:2011年的表達(dá)芯片分析和2019年的區(qū)別要求:走GEO標(biāo)準(zhǔn)分析流程分析GSE27447 代碼主要復(fù)制于Jimmy大佬的github:htt...
本文講的是aglient芯片原始數(shù)據(jù)的處理,參考資料是limma 的userguide文檔心例。GEO數(shù)據(jù)庫(kù)下載的表達(dá)矩陣不符合預(yù)期宵凌,比如是空的,或者是有負(fù)值的止后,那我們就處理一下...
前面在講GO和KEGG富集倍數(shù)(Fold Enrichment)如何計(jì)算[https://link.zhihu.com/?target=http%3A//mp.weixin....
您好瞎惫,請(qǐng)問(wèn)做出的氣泡圖為什么P值是一個(gè)定值呢,氣泡的顏色都是一樣的译株,這是為什么呢瓜喇,我自己做出來(lái)的是這樣,好不容易看到您這上面也是歉糜,不明白這是為什么乘寒,期待您解答,謝謝
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這是我聽B站鯪魚不會(huì)飛視頻(GO头谜,KEGG骏掀,DO富集分析)里的筆記哦~當(dāng)然有的地方加上的是我自己的理解,如果哪里和視頻上講的不一樣那是我自己發(fā)揮的,自行忽略.... 市面上公...
1. 非模式生物 非模式生物需要提前從AnnotationHub抓取目標(biāo)物種的OrgDb數(shù)據(jù)庫(kù)截驮,這個(gè)庫(kù)里包括Uniport笑陈,ENSEMBL,ENTREZID涵妥,REFSEQ,G...
參考這篇ID轉(zhuǎn)換不用怕,clusterProfiler幫你忙這篇詳細(xì)講了無(wú)參考基因組該怎么辦鹉勒,值得一看 簡(jiǎn)單介紹一下幾種常用的ID:Ensemble id:一般以ENSG開頭...
很久沒(méi)有閱讀書籍了帆锋,不是說(shuō)沒(méi)有翻過(guò)書禽额,是沒(méi)有好好讀一本專業(yè)以外的書了窟坐,大概有半年沒(méi)有讀書了,也不是沒(méi)有時(shí)間绵疲,而是把時(shí)間投入到了別的舒適領(lǐng)域哲鸳。昨天關(guān)注的博主說(shuō)他自己寫的書在豆瓣...
Why aren’t you guys dressed?[wa? ??nt? ju ga?z d?εst] Only takes us two minute...
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I can say with all honesty that Don has not stopped talking about your incredible prope...
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以下是B站生信技能樹GEO數(shù)據(jù)庫(kù)挖掘的課程筆記 主要內(nèi)容及學(xué)習(xí)目的: 介紹GEO數(shù)據(jù)庫(kù):了解數(shù)據(jù)存放位置盔憨; 介紹GSE項(xiàng)目的3種下載方式; 介紹ID轉(zhuǎn)換:使用R語(yǔ)言技巧實(shí)現(xiàn)基...
鑒別疾灿粞摇:室性心動(dòng)過(guò)速VT婿奔、室上性心動(dòng)過(guò)速SVTVT:寬大畸形QRS波、房室分離(P波在QRS问慎、ST-T之間)萍摊、心室?jiàn)Z獲(竇房結(jié)的心理傳導(dǎo)至心室引起正常的QRS波)、室性融合...