Hello world!
IP屬地：北京
-
訓(xùn)練集硼婿、驗證集、測試集
三者的區(qū)別訓(xùn)練集（train set） —— 用于模型擬合的數(shù)據(jù)樣本禽车。驗證集（development set）—— 是模型訓(xùn)練過程中單獨(dú)留出的樣本集寇漫，它可以用于調(diào)整模型的超參...
-
Affymetrix芯片數(shù)據(jù)質(zhì)量控制標(biāo)準(zhǔn)化（2）
直接下載該數(shù)據(jù)集的GEO series matrix 數(shù)據(jù) ---- 如果是直接下載表達(dá)矩陣的話（大多數(shù)已經(jīng)進(jìn)行標(biāo)準(zhǔn)化和背景校正） 可以查看一下處理是否得當(dāng)
-
Affymetrix芯片數(shù)據(jù)質(zhì)量控制標(biāo)準(zhǔn)化（1）本文采用GSE7014數(shù)據(jù)集作為示例數(shù)據(jù)集刪除了35-44樣本，僅保留26個樣本進(jìn)行計算分為T2DM和Control組 首先下載CEl文件和準(zhǔn)備Targets文件 第一步提取...
-
生信星球?qū)W習(xí)小組Day6
Linux環(huán)境下的軟件安裝 第一部分:下載安裝miniconda 第二部分：使用conda 以fastqc軟件為例 第三部分：conda環(huán)境 多重環(huán)境可以使用不同版本的軟件殉摔，...
-
-
生信星球?qū)W習(xí)小組Day4
第一步_安裝和加載R包 01_設(shè)置鏡像 02_安裝R包 安裝R包使用的函數(shù)取決于下載的地址 03_加載R包 第二步_dplyr包的五個基礎(chǔ)函數(shù) dplyr兩個實用技能 dpl...
-
生信星球小組Day3
向量 1標(biāo)量和向量 2從向量中提取元素 數(shù)據(jù)框 報錯save(x,file="test.Rdata")說明x這個變量不存在州胳，找到定義x變量的位置，檢查原因
-
生信星球?qū)W習(xí)小組Day2作圖 R基本操作 工作路徑設(shè)置 查看工作目錄：getwd()更改工作目錄：setwd() 查看工作路徑的文件 兩者作用相同 計算 賦值 使用<-a <- 1+2意思是把1+2...
-
生信星球?qū)W習(xí)小組Day1
markdown格式使用 標(biāo)題 標(biāo)題的使用直接在文本前加入#一級標(biāo)題 #二級標(biāo)題 ##三級標(biāo)題 ###以此類推 加粗和斜體 粗體：（粗體逸月，左右加上**） 栓撞；粗體 斜體：（斜體...
-
-
02_PCA主成分分析
主成分分析（principal component analysis恩尾，PCA）是一種常見的數(shù)據(jù)降維方法：目的是減少數(shù)據(jù)集的維數(shù)弛说，同時保持?jǐn)?shù)據(jù)集中的對方差貢獻(xiàn)最大的特征，即在“...
-
生信小白--關(guān)于批次效應(yīng)的學(xué)習(xí)及實戰(zhàn)參考教程：微信公眾號：生信星球批次效應(yīng)處理實例：combat和removebatcheffect的對比 特別感謝：人美心善愛護(hù)小白的花花老師小潔忘了怎么分身 作為一個非常想搞...
-
01_2_差異表達(dá)分析實操
R語言_Affymetrix芯片數(shù)據(jù)處理 采用數(shù)據(jù)集GSE66360 ##設(shè)置工作路徑(事先放好原始數(shù)據(jù)醒第，分組信息渔嚷，注釋文件) setwd("/Users/apple/Des...
-
