一、 簡述 ? ? 為了從基因的表達水平中得到更加具體直觀的生物學(xué)功能變化的信息洽洁，多種基于已知的基因集的分析方法應(yīng)運而生痘系。其中，基因集分析（Gene Set Analysis...
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GSA、GSEA匈勋、ssGSEA礼旅、GSVA的算法原理及它們的聯(lián)系與區(qū)別 -
RNA-seq入門實戰(zhàn)（十一）：WGCNA加權(quán)基因共表達網(wǎng)絡(luò)分析——關(guān)聯(lián)基因模塊與表型本節(jié)概覽1. WGCNA基本概念：定義饿自、關(guān)鍵術(shù)語汰翠、基本流程、一些注意事項2. WGCNA運行：?輸入數(shù)據(jù)準備①判斷數(shù)據(jù)質(zhì)量昭雌，繪制樣品的系統(tǒng)聚類樹②挑選最佳閾值power③ 構(gòu)...
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TCGA2022年新版本SNP數(shù)據(jù)處理最近課題原因需要下載TCGA項目的SNP數(shù)據(jù)复唤，按照以前的經(jīng)驗直接進TCGA下一個整合的就好，但現(xiàn)在更新之后SNP數(shù)據(jù)變成和count數(shù)據(jù)一樣是按照樣本存放的城豁，因此下載后需要整...
