@李澤宇_d391 后面報(bào)的什么的錯(cuò)蹦狂，會(huì)不會(huì)是其他原因
R: Error in (function (classes, fdef, mtable) : unable to find an inherited method for functi...第１次用ChIPseeker就遇到了這樣的問題： 然后上網(wǎng)也沒找到對(duì)應(yīng)的解決方法，無奈只好看manual,試了example也沒問題库北，然后看到peak構(gòu)造的時(shí)候航罗，seqnam...
R version 4.0.2 (2020-06-22) -- "Taking Off Again"Copyright (C) 2020 The R Foundation f...
??thanks
「Debug R」ERROR: failed to lock directory今天一個(gè)學(xué)員在R包上出現(xiàn)問題禀横，并且已經(jīng)仿佛重裝Rstudio和R，依舊沒有見效粥血。 出錯(cuò)信息如下 報(bào)錯(cuò)信息柏锄，提示無法去鎖定一個(gè)文件夾，于是出現(xiàn)了問題复亏。 經(jīng)過一番搜索和折騰趾娃，發(fā)現(xiàn)...
構(gòu)造peak那個(gè)GRanges對(duì)象的時(shí)候用"chr1","chr2"…這種形式表示染色體笤成，改下這里，不知道我這次說清楚沒
R: Error in (function (classes, fdef, mtable) : unable to find an inherited method for functi...第１次用ChIPseeker就遇到了這樣的問題： 然后上網(wǎng)也沒找到對(duì)應(yīng)的解決方法眷茁，無奈只好看manual,試了example也沒問題炕泳，然后看到peak構(gòu)造的時(shí)候，seqnam...
就是把peak里面的seqnames改成了"chr1""chr2"…這樣子上祈，之前我的數(shù)據(jù)是"1"培遵，"2"…這樣用數(shù)字表示的染色體編號(hào)浙芙，應(yīng)該要用"chr1","chr2"這種形式的，你試試看荤懂，看能解決你的問題嗎
R: Error in (function (classes, fdef, mtable) : unable to find an inherited method for functi...第１次用ChIPseeker就遇到了這樣的問題： 然后上網(wǎng)也沒找到對(duì)應(yīng)的解決方法茁裙，無奈只好看manual,試了example也沒問題，然后看到peak構(gòu)造的時(shí)候节仿，seqnam...
這是ggplot2可視化專題的第一個(gè)實(shí)例操作 ggplot2的基本思路見前文總論：基于ggplot2的RNA-seq轉(zhuǎn)錄組可視化：總述和分文目錄 【ggplot2繪圖具體策略...
Kallisto下游推薦的分析軟件是Sleuth，所以我們本次介紹如何使用Sleuth進(jìn)行相關(guān)的分析荐操。 RNA-seq在完成轉(zhuǎn)錄本的鑒定及定量后芜抒，我們經(jīng)常做的分析之一就是差異...
以前做基因注釋總用R包：TxDb.Hsapiens.UCSC.hg38.knownGene宅倒，但是今天做發(fā)現(xiàn)１個(gè)問題，就是有的基因特別長(zhǎng)屯耸，與ncbi中檢索出來的不一樣拐迁，查找原因...
轉(zhuǎn)錄因子(Transcription Factors, TFs)指能夠以序列特異性方式結(jié)合DNA并且調(diào)節(jié)轉(zhuǎn)錄的蛋白質(zhì)。轉(zhuǎn)錄因子通過識(shí)別特定的DNA序列來控制染色質(zhì)和轉(zhuǎn)錄疗绣，以形...
第１次用ChIPseeker就遇到了這樣的問題： 然后上網(wǎng)也沒找到對(duì)應(yīng)的解決方法线召，無奈只好看manual,試了example也沒問題，然后看到peak構(gòu)造的時(shí)候多矮，seqnam...
前幾天灶搜，要用enrichplot,就需要升級(jí)Ｒ，然后要升級(jí)的時(shí)候又發(fā)現(xiàn)一個(gè)終極問題工窍，升級(jí)系統(tǒng)割卖，可悲的我用的是ubuntu 17.10,不升級(jí)就裝不了Ｒ，可升級(jí)也不是那么順利：...
