240 發(fā)簡(jiǎn)信
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  • 請(qǐng)問(wèn)2.4中zhujieshu.repeat.gff3是怎么來(lái)的呀浩螺?

    基因組circos圖繪制流程記錄

    一岸蜗、Circos安裝 conda 安裝 conda create --name circos conda install circos 二、circos輸入文件準(zhǔn)備 前提必須...

  • 作者欧聘,這個(gè)可以加個(gè)參數(shù)設(shè)定產(chǎn)物的大小嗎捂蕴?

    qPCR | 熒光定量?批量設(shè)計(jì)引物茁计,一鍵搞定料皇!

    寫在前面 Emmm,轉(zhuǎn)錄組篩了十來(lái)個(gè)基因星压,想著擴(kuò)大材料看看表達(dá)模式是否與數(shù)據(jù)體現(xiàn)相符践剂,于是需要設(shè)計(jì)一下qPCR引物。當(dāng)然娜膘,自然是有一些軟件可以使用逊脯,但用起來(lái)不太方便。至少問(wèn)了...

  • 老師好竣贪,找到多胞后军洼,怎么去掉呢巩螃?

    DoubletFinder

    相信各位做單細(xì)胞的童鞋們,都遇到過(guò)去除多細(xì)胞的情況匕争,而Cellranger默認(rèn)的是前1%(3000cell)避乏,對(duì)于低質(zhì)量的細(xì)胞有了算法來(lái)確認(rèn)是否保留,但是對(duì)于多細(xì)胞而言甘桑,Ce...

  • 請(qǐng)問(wèn)一下拍皮,輸出結(jié)果中有些null的,例如 Loupe Cell Browser file扇住,這是為什么啊春缕,對(duì)后續(xù)分析會(huì)有影響嗎?

    cellranger更新到6.0啦(全新使用教程)

    cellranger是10X GENOMICS單細(xì)胞上游分析的軟件艘蹋,主要有4個(gè)流程 mkfastq锄贼、定量 count、組合 aggr女阀、reanalyze宅荤。如果是bcl原始測(cè)序...

  • 120
    學(xué)習(xí)一遍ChIPseeker的使用

    劉小澤寫于2020.5.23-24Y叔的原文在:https://mp.weixin.qq.com/s/3CMj0xejiV-FSMC-Vxd_-w 0 ChIPseeker的...

  • 您好,請(qǐng)問(wèn)一下植物的gff3文件不標(biāo)準(zhǔn)浸策,做出來(lái)的txdb不能用怎么解決呀冯键?謝謝!

    學(xué)習(xí)一遍ChIPseeker的使用

    劉小澤寫于2020.5.23-24Y叔的原文在:https://mp.weixin.qq.com/s/3CMj0xejiV-FSMC-Vxd_-w 0 ChIPseeker的...

  • 請(qǐng)問(wèn)博主文中用的數(shù)據(jù)是在哪下載的呀庸汗?

    deepTools 的使用(一)

    官方參考 https://deeptools.readthedocs.io/en/develop/content/installation.html 下載安裝 python ...

  • 120
    deepTools 的使用(一)

    官方參考 https://deeptools.readthedocs.io/en/develop/content/installation.html 下載安裝 python ...

  • 植物構(gòu)建txdb對(duì)象

    使用genomicfeatures來(lái)構(gòu)建txdb對(duì)象惫确,首先就是安裝對(duì)應(yīng)的包 if (!requireNamespace("BiocManager", quietly = TR...

  • 樓主好,我根據(jù)您的方法把第一列都改成了“chr+數(shù)字”蚯舱,但是后面依然報(bào)錯(cuò)改化,請(qǐng)問(wèn)您知道怎么回事嗎?

    R: Error in (function (classes, fdef, mtable) : unable to find an inherited method for functi...

    第1次用ChIPseeker就遇到了這樣的問(wèn)題: 然后上網(wǎng)也沒(méi)找到對(duì)應(yīng)的解決方法枉昏,無(wú)奈只好看manual,試了example也沒(méi)問(wèn)題陈肛,然后看到peak構(gòu)造的時(shí)候,seqnam...

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