臨畢業(yè)不到2年，臨床博導(dǎo)一錘定音拒絕濕實驗，讓我們就做生信鹉究！誰能想到搁嗓，導(dǎo)師本身沒有生信背景贬丛，卻要求自學(xué)生信呢扇救？ 拖到現(xiàn)在還剩1年多志珍，我的科研進展有限橙垢，最關(guān)鍵的是在學(xué)習(xí)熱情乃至...
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【隨筆】既來之則安之
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【動植物研究動態(tài)】2022年1-3月收藏的文獻
微信收藏夾中的文獻解讀，只整理出今年2022年已收藏的部分文獻伦糯，之前的太多柜某，不列了嗽元。后續(xù)計劃每周更一次，自己會看得更認真點莺琳，解讀更詳細些还棱。 Nature Genetics |...
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【R報錯】解決Linux下安裝clusterProfiler：object 'get_fun_from_pkg' not found
報錯 R version 4.0.3 $RBiocManager::install("clusterProfiler") 解決 原因是rvcheck版本太舊。 1.重新安裝...
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WGCNA分析秤茅，簡單全面的最新教程本文應(yīng)該是第二全的WGCNA分析教程稚补，參考了最新的文檔。第一全的還在路上框喳，會出現(xiàn)于生信寶典和宏基因組公眾號組織的二代三代轉(zhuǎn)錄組測序分析實戰(zhàn)班上课幕，歡迎點擊鏈接了解更多。 WGC...
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TCGA差異分析|2.DESeq2DESeq2真狠五垮，TCGA-PRAD數(shù)據(jù)差異分析用了半個小時乍惊，而且還是多線程。這速度也沒啥提升呀 聲明：本文僅供學(xué)習(xí)交流用放仗，禁止用于商業(yè)用途润绎，如有侵權(quán)，請聯(lián)系刪除诞挨。參考鏈接：...
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【搬磚】計算HRD（first try）HRD score = LOH + TAI + LST 參考：Sztupinszki et al, Migrating the SNP array-based homolog...
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Rstudio包管理一網(wǎng)打盡莉撇，最全的R包管理終極教程Rstudio/R的包（package）管理是個老生常談的問題，很少有人去總結(jié)惶傻，因為大家都認為比較簡單棍郎。今天我就把所有的安裝和管理R包的方法一起寫一寫。 一达罗、包在哪里坝撑？ CR...
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單基因的腫瘤細胞系表達怎么看？CCLE告訴你泛癌的基因表達量一般可以用TCGA和GTEx實現(xiàn)粮揉，但是腫瘤細胞系一般用CCLE臨床生信之家[https://www.aclbi.com/static/index.html#/...
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處理CLIP-seq數(shù)據(jù)的方法總結(jié)
CLIP-seq結(jié)合了實驗和測序方法，可以研究某種蛋白質(zhì)在體內(nèi)的RNA的結(jié)合情況抚笔。原理為基于RNA和RNA結(jié)合蛋白在紫外線照射下發(fā)生偶聯(lián)扶认，再經(jīng)過蛋白特異性抗體將其沉淀，回收片...
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【科研工具】Zotero+Zotfile+堅果云實現(xiàn)mac ipad端同步一直用endnote殊橙，電腦端用得還行辐宾，但是個人覺得endnote不同終端的同步有點慢狱从。轉(zhuǎn)手學(xué)習(xí)Zotero配合堅果云同步，實現(xiàn)ipad端閱讀文獻做筆記叠纹，并可在電腦端同步閱讀季研。...
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當來到運動系統(tǒng)時，你會想到什么誉察？如題：當來到運動系統(tǒng)時与涡，你會想到什么？以什么問題的切入持偏，將直接決定我們在一開始見到它時它呈怎樣的面目驼卖。如同我們要去了解一個陌生人，我們也總是會先想幾個問題鸿秆，然后與之交流酌畜，以圖...
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9. 學(xué)習(xí)與記憶的相關(guān)腦區(qū)【整理】 —— 認知神經(jīng)科學(xué)系列文學(xué)習(xí)記憶是大腦最基本也是最重要的高級神經(jīng)功能之一蛮寂，一般認為，學(xué)習(xí)主要是指人或動物通過神經(jīng)系統(tǒng)接受外界環(huán)境信息而影響自身行為的過程易茬， 記憶是指獲得的信息或經(jīng)驗在腦內(nèi)貯存和提瘸晏！（...
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NGS二代測序技術(shù)與轉(zhuǎn)化醫(yī)學(xué)研究--3.溶瘤病毒denovo組裝溶瘤病毒基因組denovo[http://blog.sciencenet.cn/blog-635619-902677.html]組裝 溶瘤病毒[http://www.s...
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NGS二代測序技術(shù)與轉(zhuǎn)化醫(yī)學(xué)研究--2.RNA-seq部分RNA-seq轉(zhuǎn)錄組測序 與cfDNA體細胞突變檢測相比范抓，基因表達相關(guān)的RNA-seq轉(zhuǎn)錄組測序在常規(guī)的mRNA、非編碼RNA[http://www.ibp.cas....
