發(fā)簡信
IP屬地：浙江
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【隨筆】既來之則安之
臨畢業(yè)不到2年有滑，臨床博導一錘定音拒絕濕實驗癣诱，讓我們就做生信浪蹂！誰能想到犁功，導師本身沒有生信背景花墩，卻要求自學生信呢雳刺？ 拖到現(xiàn)在還剩1年多盔性，我的科研進展...
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【搬磚】計算HRD（first try）HRD score = LOH + TAI + LST 參考：Sztupinszki et al, Migrating the SNP arra...
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【科研工具】Zotero+Zotfile+堅果云實現(xiàn)mac ipad端同步一直用endnote仲锄，電腦端用得還行劲妙，但是個人覺得endnote不同終端的同步有點慢。轉(zhuǎn)手學習Zotero配合堅果云同步儒喊，實現(xiàn)ipad端閱讀文獻...
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【血的教訓】樣本名對應镣奋！
看到這條的朋友們趕緊打開你們的代碼，看看你們的matrix列名和臨床數(shù)據(jù)里的樣本名的順序有沒有對應上怀愧，特別是做過combat合并處理的datas...
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【搬磚】整理datasets——去除批次效應背景 上次選擇了一個新開發(fā)的跨平臺歸一化工具 MatchMixeR侨颈，（失敗了），但是在文章里發(fā)現(xiàn)作者把自己的工具與已有的工具進行比較芯义，順藤摸瓜發(fā)...
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【搬磚】【MatchMixeR無法使用】對不同GPL的microarray測序結(jié)果歸一化分析GEO下載下來的文件哈垢，通常單個GEO文件內(nèi)包含的樣本量不夠大，用起來結(jié)果不太好扛拨，因此往往需要考慮將多個GEO文件匯總呈一個compile耘分。G...
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GPL文件 一個探針對應多個symbol 整理成data.frame 【已解決】雖說簡單，但對R語言不熟悉的人來說還是需要指點一下绑警，才會用求泰。首先是GPL下載的文件，以GPL96為例计盒。 提取最感興趣的3列渴频。 好的，接下來需要得...
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【搬磚】構(gòu)建預后signature 實踐Cox 回歸模型 寫在最開頭：誠心推薦解螺旋麥子的Cox回歸模型R教學視頻Ｕ掠簟Ｍ鞯志衍！如果你對cox還稀里糊涂的，下面的鏈接聊替，點楼肪！15分鐘就能GET超...
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【簡單掌握】不同基因表達間的相關(guān)系數(shù)計算及作圖相關(guān)系數(shù)計算：相關(guān)系數(shù)、P值 相關(guān)系數(shù)作圖 補充ggcorrplot 更詳細的作圖細節(jié)可參考：http://www.reibang.com/p...