適用于 NCBI 數(shù)據(jù)庫中 gff 格式文件轉(zhuǎn)換為 gtf 格式，使用 perl 代碼實(shí)現(xiàn)：
發(fā)簡信
IP屬地：福建
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NCBI gff/gff3 轉(zhuǎn)換為 gtf 格式
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RNA-seq數(shù)據(jù)計數(shù)矩陣標(biāo)準(zhǔn)化
7種常見的標(biāo)準(zhǔn)化方法霍殴，它們分別是： 所有這些方法又可根據(jù)其原理而分為兩類，第一類基于庫的大小(TMM，DESeq)看靠，第二類基于read數(shù)目的分布(TC，UQ液肌，Med挟炬，Q，RP...
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使用seqtk來分割混合的fastq序列
前幾天從SRA數(shù)據(jù)庫下載的.sra數(shù)據(jù)在解壓的時候沒有使用 fastq-dump--split-files DRR**來分割兩個文件，而是直接生成了一個fastq文件 然而我...
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PacBio測序相關(guān)知識
Pacific Bioscience公司簡稱PacBio 讀長可達(dá)2-3萬個堿基老速，平均長度8千個粥喜。 Pacbio測序也是邊合成邊測序。 DNA polymor固定在玻璃底板上...
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2018-03-13
二橘券，Illumina Hiseq 測序的相關(guān)內(nèi)容 組成： 1额湘，高精度顯微光學(xué)掃描儀 2，一整套液流系統(tǒng) 3旁舰，計算機(jī)軟硬件 4锋华，溫控系統(tǒng) flowcell---lane---s...
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2018-03-12
一，illumina測序相關(guān)知識 文庫：DNA片段兩端加上特定的DNA接頭鬓梅。 文庫制作步驟： 1供置，超聲波打斷DNA 2，將斷裂的兩端用酶補(bǔ)平绽快。 3芥丧，用taq酶在補(bǔ)平的3‘端加...
