檢查一下vcf文件是不是對(duì)的技掏，然后看看你的命令@15bbf6432e00
群體遺傳學(xué)親緣關(guān)系分析親緣關(guān)系分析實(shí)操 前期準(zhǔn)備 給標(biāo)記加上ID SNP data通常都是以VCF格式文件呈現(xiàn)，拿到VCF文件的第一件事情就是添加各個(gè)SNP位點(diǎn)的ID滋迈。先看一下最開(kāi)始生成的VCF文...
@Yanglab_xuan 對(duì) 平均值就行
群體遺傳學(xué)統(tǒng)計(jì)指標(biāo)——群體間分歧度檢驗(yàn)（Fst）基本概念 Fst：群體間遺傳分化指數(shù)罪郊，是種群分化和遺傳距離的一種衡量方法，分化指數(shù)越大，差異越大乎折。適用于亞群體間多樣性的比較绒疗。用于衡量種群分化程度，取值從0到1骂澄，為0則認(rèn)為兩...
您需要哪一個(gè)文件吓蘑？@Journey_34ee
群體結(jié)構(gòu)——PCA分析概念 PCA（principal components analysis）即主成分分析。主成分分析也稱主分量分析坟冲，旨在利用降維的思想磨镶，把多指標(biāo)轉(zhuǎn)化為少數(shù)幾個(gè)綜合指標(biāo)。 在統(tǒng)計(jì)...
@會(huì)發(fā)光的欣欣子 換一臺(tái)電腦健提？我沒(méi)遇到過(guò)這個(gè)問(wèn)題誒琳猫。。私痹。脐嫂。
單體型網(wǎng)絡(luò)的構(gòu)建——Haplotype Network基本概念 單體型：又稱單倍體型或單元型，是個(gè)體組織中侄榴，完全遺傳自父母雙方中某一親本的一組等位基因雹锣。擁有特定SNP的個(gè)體常常在附近某一特定變異位點(diǎn)擁有特定等位基因，這種關(guān)系叫做...
就是個(gè)人習(xí)慣癞蚕，可以不加滴~
群體遺傳學(xué)親緣關(guān)系分析親緣關(guān)系分析實(shí)操 前期準(zhǔn)備 給標(biāo)記加上ID SNP data通常都是以VCF格式文件呈現(xiàn)蕊爵，拿到VCF文件的第一件事情就是添加各個(gè)SNP位點(diǎn)的ID。先看一下最開(kāi)始生成的VCF文...
您過(guò)濾前有多少個(gè)snp桦山？
群體遺傳學(xué)親緣關(guān)系分析親緣關(guān)系分析實(shí)操 前期準(zhǔn)備 給標(biāo)記加上ID SNP data通常都是以VCF格式文件呈現(xiàn)攒射，拿到VCF文件的第一件事情就是添加各個(gè)SNP位點(diǎn)的ID。先看一下最開(kāi)始生成的VCF文...
我的經(jīng)歷非澈闼坎坷会放，寫一寫供大家參考： 當(dāng)時(shí)的個(gè)人背景： 教育背景：農(nóng)大在讀三年級(jí)博士，本科和研究生都是在這所學(xué)校钉凌；專業(yè)方向：預(yù)防醫(yī)學(xué)咧最；簽證項(xiàng)目：交流學(xué)者（J1簽證）資金來(lái)源：...
在后面有描述的呀，其實(shí)就是樣本的分組信息御雕。
群體結(jié)構(gòu)——PCA分析概念 PCA（principal components analysis）即主成分分析矢沿。主成分分析也稱主分量分析，旨在利用降維的思想酸纲，把多指標(biāo)轉(zhuǎn)化為少數(shù)幾個(gè)綜合指標(biāo)捣鲸。 在統(tǒng)計(jì)...
要看你的目的，如果是看差異其實(shí)我建議不過(guò)濾闽坡，保留最大差異栽惶。
群體結(jié)構(gòu)——系統(tǒng)發(fā)育樹的構(gòu)建最近雜事真的非常的滿愁溜，終于找到時(shí)間更新一下。外厂。冕象。。 通過(guò)上一篇文章的介紹酣衷，系統(tǒng)發(fā)育樹的基本概念[http://www.reibang.com/p/4c5a4bf84e57]...
@Jan_d2fa 沒(méi)有該過(guò)欸交惯，報(bào)錯(cuò)原因應(yīng)該是Pophelper的版本問(wèn)題，不能用最新版的穿仪，建議使用V2.29席爽。
群體結(jié)構(gòu)——Structure堆疊圖詳細(xì)畫法基本概念 基迪奧有篇文章寫得非常的簡(jiǎn)單明了，我這里就不再贅述啊片，大家移步去搞清楚基本知識(shí)只锻。 群體結(jié)構(gòu)圖形——structure堆疊圖[https://www.genedenov...
這個(gè)沒(méi)有研究過(guò)欸，要查一查
群體結(jié)構(gòu)——Structure堆疊圖詳細(xì)畫法基本概念 基迪奧有篇文章寫得非常的簡(jiǎn)單明了紫谷，我這里就不再贅述齐饮，大家移步去搞清楚基本知識(shí)。 群體結(jié)構(gòu)圖形——structure堆疊圖[https://www.genedenov...
要做選擇性消除分析笤昨，首先就要把如下的理論記住熟記于心祖驱。 中性進(jìn)化假說(shuō)： 分子水平上，生物的演化或物種的進(jìn)化并不是自然選擇引起的瞒窒，而是由中性/近中性的突變等位基因經(jīng)過(guò)遺傳漂變引...
@e5a867a4f72e fpkm
轉(zhuǎn)錄組趨勢(shì)分析基本概念 表達(dá)趨勢(shì)分析（Series Test of Cluster）：將變化特征模式相似的基因歸類到一種變化趨勢(shì)中捺僻，從而找到實(shí)驗(yàn)變化過(guò)程中最具有代表性的基因集以及對(duì)應(yīng)的趨勢(shì)...
-2. 在一篇講泥炭蘚的MBE看到了dfoil的使用 《Extensive Genome-Wide Phylogenetic Discordance Is Due to In...
基本概念： 基因流（也稱基因遷移） 是指從一個(gè)物種的一個(gè)種群向另一個(gè)種群引入新的遺傳物質(zhì)，從而改變?nèi)后w“基因庫(kù)”的組成崇裁。通過(guò)基因交流向群體中引入新的等位基因匕坯，是遺傳變異一個(gè)非...
@Kissdog丶痕跡 您好，最近都沒(méi)看消息 不好意思拔稳，現(xiàn)還有問(wèn)題嗎葛峻？
群體結(jié)構(gòu)——PCA分析概念 PCA（principal components analysis）即主成分分析。主成分分析也稱主分量分析巴比，旨在利用降維的思想术奖，把多指標(biāo)轉(zhuǎn)化為少數(shù)幾個(gè)綜合指標(biāo)。 在統(tǒng)計(jì)...
@wow咪來(lái)哆 沒(méi)問(wèn)題的轻绞，這個(gè)腳本只是把第一列和第二列合并腰耙。
群體遺傳學(xué)親緣關(guān)系分析親緣關(guān)系分析實(shí)操 前期準(zhǔn)備 給標(biāo)記加上ID SNP data通常都是以VCF格式文件呈現(xiàn)，拿到VCF文件的第一件事情就是添加各個(gè)SNP位點(diǎn)的ID铲球。先看一下最開(kāi)始生成的VCF文...
是不是版本沖突啊晰赞？換一臺(tái)電腦試試稼病？
單體型網(wǎng)絡(luò)的構(gòu)建——Haplotype Network基本概念 單體型：又稱單倍體型或單元型选侨，是個(gè)體組織中，完全遺傳自父母雙方中某一親本的一組等位基因然走。擁有特定SNP的個(gè)體常常在附近某一特定變異位點(diǎn)擁有特定等位基因援制，這種關(guān)系叫做...
