關于OrthoFinder 的介紹匿又、安裝方灾、使用等資料匯總。
發(fā)簡信
IP屬地：廣東
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2021-11-23集群安裝R包GOstats安裝R包GOstats，出現(xiàn)以下錯誤： ERROR: dependency ‘httr’ is not available for package ‘KEGGREST’ * ...
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2021-08-04：GO富集網(wǎng)絡可視化工具利用Cytoscape上的插件可以實現(xiàn)GO 分析的網(wǎng)絡化痛单，不過非模式植物會很麻煩：具體參考了簡書的以下內(nèi)容： Bingo(Cytoscape插件)GO功能富集分析 - 簡書 ...
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主要關注于脊椎動物適應性進化與比較基因組學研究<br>簡書原賬號：WhyDoWeAge
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GO富集可視化：clusterProfiler+GOplot現(xiàn)在的社會正處于大數(shù)據(jù)時代旭绒，生物學研究領域也迎來了大組學時代鸟妙。無論是植物。動物挥吵，還是微生物重父，都有許多物種被測序。在后續(xù)的個性化分析過程中忽匈，通常會得到龐大的基因數(shù)據(jù)房午，如何選擇一...
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喜歡深海鯨魚的悲鳴郭厌，也熱愛歡快的鳥語花香！<br>
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2021-07-09：細數(shù)我在GO注釋時遇到的那些報錯
上回說到，我廢了九牛二虎之力萎羔，終于拿到了百十來個GB的GO EVIDENCE 數(shù)據(jù)液走，你猜怎么著，接著往下進行的時候發(fā)現(xiàn)贾陷，R語言根本讀不了缘眶。。髓废。巷懈。心疼自己一秒鐘 來吧，今天接著...
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2021-07-04--GO富集之馬鈴薯的EVIDENCE不好搞
一連試了幾天用集群的R構建EVIDENCE,結果并不能讓我滿意慌洪，基本上一天只能跑一個顶燕，再運行第二個的時候就會報錯凑保。嘗試到現(xiàn)在就只剩下馬鈴薯的還未成功了，暫時先把問題撂在這涌攻，我...
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2021-07-01
昨天忙著做實驗欧引，沒時間鼓搗數(shù)據(jù)，今天也得做實驗恳谎，不過在試驗開始之前還是先整理一下吧： 首先是安裝R包 嘗試本地運行后發(fā)現(xiàn)芝此，報錯： 本地內(nèi)存太小，程序無法運行因痛。 到集群上運行婚苹，...
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2021-06-29：Go注釋的相關操作記錄主要參考：(4條消息) 無參轉錄組GO、KEGG富集分析——diamond+idmapping+GOstats_ygyxl的博客-CSDN博客[https://blog.cs...
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Linux集群中安裝miniconda2主要參考：conda管理生信軟件一文就夠 (qq.com)[https://mp.weixin.qq.com/s?__biz=MzAxMDkxODM1Ng==&mid=224...
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2021-06-28 Rstdio中DESeq2相關軟件的安裝
#首先升級R install.packages("installr") library(installr) updateR() library("BiocManager") ...
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2021-06-27--致病疫霉的差異基因表達分析
在Rstdio軟件里使用DESeq2進行致病疫霉及茄科植物的差異基因表達分析鸵膏，茄科植物由于隸屬不同物種膊升，各個基因有所差異，故優(yōu)先進行縱向比較谭企，即比較接種不同時間點下同一植物的...
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生物信息學<br>干細胞轉化醫(yī)學
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簡書太垃圾了，已經(jīng)棄用攀操，改用語雀
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