科研狗對(duì)美的追求是永無(wú)止境的议街。為了一張好看的實(shí)驗(yàn)結(jié)果圖豁生，那是赴湯蹈火譬巫，在所不惜组哩。下面就跟大家介紹一個(gè)美化進(jìn)化樹(shù)的利器——iTOl等龙。本文主要向大...

前言 小編要分享的這篇文章是2020年10月19發(fā)表在Nature Communications雜志上，很榮幸征得作者本人（北京林業(yè)大學(xué)林木...

由OrthoFinder軟件可產(chǎn)生大量的分析結(jié)果，用于多種分析琅翻，下面介紹用產(chǎn)生的文件畫系統(tǒng)發(fā)育樹(shù)位仁。 1.基因樹(shù)(Gene Trees) 根據(jù)每個(gè)...

尋找同源蛋白家族用的比較多的是Orthomcl柑贞，但是該軟件多年前已經(jīng)停止更新，且使用的時(shí)候需要安裝和使用MySQL聂抢，操作起來(lái)比較繁瑣钧嘶。因...

最近剛返校有决，事情比較多，每天也很忙空盼，之前寫的《基因家族擴(kuò)張與收縮分析及物種進(jìn)化樹(shù)構(gòu)建（上）》也一直沒(méi)來(lái)得及更新书幕，缺少cafe輸出結(jié)果的解讀及后面...

一、數(shù)據(jù)準(zhǔn)備 首先我注，選取不同物種的Protein數(shù)據(jù)集：Arabidopsis_thaliana.fa按咒；Citrus_grandis.fa；Di...