細(xì)胞注釋是單細(xì)胞分析中很關(guān)鍵的環(huán)節(jié)，初期會(huì)比較痛苦，做多了才會(huì)悟出一些規(guī)律呼畸。 我公眾號(hào)早期寫(xiě)過(guò)幾篇細(xì)胞注釋相關(guān)的帖子： 單細(xì)胞分析實(shí)錄(7): 差異表達(dá)分析/細(xì)胞類(lèi)型注釋 S...
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【單細(xì)胞轉(zhuǎn)錄組】人類(lèi)B細(xì)胞亞群分析Marker基因匯總由于基因表達(dá)跟細(xì)胞表面蛋白的表達(dá)具有時(shí)間差，所以要根據(jù)經(jīng)驗(yàn)具體情況具體分析搬素，內(nèi)容僅供參考 ??哺乳類(lèi)動(dòng)物B細(xì)胞的分化過(guò)程主要可分為前B細(xì)胞极谊、不成熟B細(xì)胞蛾号、 成熟B細(xì)胞锌蓄、活化B...
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GSEA學(xué)習(xí)筆記春節(jié)后的第一次寫(xiě)學(xué)習(xí)筆記升筏，還是要提醒大家沒(méi)事別聚集撑柔、別聚集、別聚集您访！重要的事情說(shuō)三遍铅忿！ 前幾天看到公眾號(hào)里寫(xiě)了GSEA的文章，雖然我之前跟著很多網(wǎng)上的教程走過(guò)一遍GSEA分析...
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暫別簡(jiǎn)書(shū)灵汪，后會(huì)有期
我不是老師檀训，也不是大神，更不是前輩享言。我只是個(gè)普通的科研工作者肢扯，一個(gè)只想努力變得更好的人。 來(lái)到簡(jiǎn)書(shū)快3年了担锤，期間寫(xiě)了不少的筆記。很多的筆記是在疫情嚴(yán)重時(shí)wfh的時(shí)候?qū)懙恼ё辍Ｖ两?..
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一文解決單細(xì)胞亞群注釋的所有問(wèn)題
好久沒(méi)更新了肛循，上來(lái)小編得寫(xiě)一個(gè)有分量的推文暖暖場(chǎng)。其實(shí)細(xì)想一下银择，不能全歸因于平時(shí)太忙（還是太懶了）多糠，因?yàn)樽罱吹狡渌芏嘈』锇樽龅暮芎们叶荚诓粩喔隆Ｆ鋵?shí)抽出時(shí)間寫(xiě)一寫(xiě)推文對(duì)...
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免疫細(xì)胞注釋-3：B細(xì)胞scRNAseq免疫細(xì)胞注釋?zhuān)?免疫細(xì)胞注釋-1：T細(xì)胞[http://www.reibang.com/p/0127c9b380c9] 免疫細(xì)胞注釋-2：髓系細(xì)胞[http...
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R四大高效編程神器——apply家族
本節(jié)提要：apply()函數(shù)sapply()函數(shù)lapply()函數(shù)tapply()函數(shù) 熟悉R編程的人都知道R語(yǔ)言的apply家族浩考，而R語(yǔ)言入門(mén)容易夹孔，簡(jiǎn)單學(xué)一學(xué)就能寫(xiě)出一些...
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RNA-seq的counts值，RPM, RPKM, FPKM, TPM 的異同
RNA-seq的counts值析孽，RPM, RPKM, FPKM, TPM 的異同 現(xiàn)在常用的基因定量方法包括：RPM, RPKM, FPKM, TPM搭伤。這些表達(dá)量的主要區(qū)別是...
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