小明的數(shù)據(jù)分析筆記本

寫在前面 一年前形病，我看到課題組其他成員在整一個“進化保守區(qū)塊”挖掘的工作。說實話，覺得....挺麻煩漠吻。于是我寫了一個工具量瓜，具體見推文《進化保守的基因區(qū)塊-可視化挖掘》。 這個...

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1 站在審稿人的角度考慮問題 1.1審稿人很忙審稿人多是已畢業(yè)博士途乃，在高猩馨粒或研究生工作，通常比較忙耍共。 1.2審稿工作一般都是免費的烫饼。為什么審稿人愿意免費審稿？（1）通過審稿可...

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01 什么是全基因組復制 多倍化（polyploidy）或全基因加倍/復制（whole genome duplication, WGD）事件是指基因組內(nèi)的所有序列都發(fā)生重復试读，...

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在自然群體（區(qū)別于強人工選擇）中杠纵，如果我們感興趣的數(shù)量性狀表現(xiàn)出與特定的地理環(huán)境變量有高度的關聯(lián)性，隨著環(huán)境變量的改變而變化钩骇，則這些環(huán)境變量往往反映了環(huán)境作用于個體表型的選擇...

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寫在前面 目前還是在繼續(xù)整一些擦邊“比較基因組”的工具。前段時間停下來倘屹，原因只有一個：我發(fā)現(xiàn) TBtools 的Simple Ka/Ks Calculator 速度確實不夠快...

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一银亲、什么是單倍型？ 在單倍型分析前纽匙，首先需要明白什么是單倍型群凶、什么是基因單倍型？ 一般來講哄辣，所謂的單倍型是指同一染色體上不同變異位點的各種線性組合形式请梢。那么基因單倍型自然就是...

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已有的工具如circos, 只能繪制彎的染色體，又如R包chromoMap力穗，IdeoViz毅弧，karyploteR，ggbio和在線工具Idiographica当窗，雖然能繪制直的...

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https://github.com/mdozmorov[https://github.com/mdozmorov] _notes結尾的倉庫名基本都是相關領域的學習資料

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什么是三元相圖 三元圖是重心圖的一種够坐，它有三個變量，但需要三者總和為恒定值崖面。在一個等邊三角形坐標系中元咙，圖中某一點的位置代表三個變量間的比例關系。在群體遺傳學中巫员，它被稱做Fin...