發(fā)簡(jiǎn)信
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DimPlot散點(diǎn)圖解決顏色疊加問(wèn)題問(wèn)題： 有時(shí)候拿到的樣本的UMAP圖形如下：灰色的細(xì)胞點(diǎn)多于紫色的細(xì)胞點(diǎn)，顯示的結(jié)果都是都一個(gè)樣本的細(xì)胞 針對(duì)以上問(wèn)題DimPlot有個(gè)參數(shù)：s...
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單細(xì)胞細(xì)胞定義單細(xì)胞細(xì)胞定義合集 對(duì)于單細(xì)胞數(shù)據(jù)細(xì)胞分群的定義酸钦，一直是困惑大家的工作异袄。對(duì)一直從事單細(xì)胞數(shù)據(jù)分析的工作人員，細(xì)胞定義非常簡(jiǎn)單冤灾；但是新手小白來(lái)說(shuō)還...
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利用ggplot2繪制SCI樣式的UMAP圖Seurat包展示出來(lái)的umap/tsne圖都是帶有橫縱坐標(biāo)前域，基于Seurat包可能比較難調(diào)整圖片的樣式，只能借助AI或者PS處理圖片韵吨。這次借助...
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單細(xì)胞SRR數(shù)據(jù)拆分
10X單細(xì)胞轉(zhuǎn)錄組測(cè)序數(shù)據(jù)的 SRA轉(zhuǎn)fastq fastq-dump SRA轉(zhuǎn)fastq 參考鏈接：10X單細(xì)胞轉(zhuǎn)錄組測(cè)序數(shù)據(jù)的 SRA轉(zhuǎn)fa...
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ggplot2 金字塔圖形（雙向柱狀圖）這篇文章主要是分享一下金字塔圖形的繪制方法匿垄，其來(lái)源是文章中的圖E，如下： 看了一下归粉，可以通過(guò)ggplot2來(lái)實(shí)現(xiàn)椿疗，數(shù)據(jù)來(lái)自于自己試驗(yàn)的數(shù)據(jù)（該數(shù)...
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Shell腳本循環(huán)讀取文件內(nèi)容,文件列表和配置文件
1、使用for循環(huán) -文件內(nèi)容 or 2盏浇、使用for循環(huán) -文件名稱 or 3.使用while循環(huán) -文件名稱 4.使用source循環(huán) 讀取配...
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R-如何在圖表左側(cè)的pheatmap中顯示行名变丧？問(wèn)題 我正在使用R中的pheatmap包制作熱圖。默認(rèn)情況下绢掰，行名顯示在熱圖的右側(cè)痒蓬。有誰(shuí)知道如何將它們移到左側(cè)？ 其他一些軟件包似乎對(duì)此具有功能...
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FASTA和FASTQ
FASTA FASTA文件主要由兩個(gè)部分構(gòu)成：序列頭信息（有時(shí)包括一些其它的描述信息）和具體的序列數(shù)據(jù)滴劲。頭信息獨(dú)占一行攻晒，以大于號(hào)（>）開(kāi)頭作為識(shí)...
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CellRanger網(wǎng)頁(yè)報(bào)告淺藍(lán)色部分下面的內(nèi)容是從10X cellranger 官網(wǎng)里面看到的關(guān)于cellranger3.0以后的版本網(wǎng)頁(yè)報(bào)告中的淺藍(lán)色部分如何計(jì)算得到的講解。 C...