發(fā)簡信
IP屬地：新澤西州
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一行代碼合并多個空間轉錄組數據
寫了個簡單的程序用于空間轉錄組數據的和整合，包含的合并方法有以下幾種：1.CCA（基于Seurat）2.Harmony3.FastMNN（基于b...
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EX-ST 膨脹的空間轉錄組最近Nature Method 發(fā)表了一篇很有意思的文章，講述了一個基于Visium改進型的空間轉錄組卿堂，文章借用了Mechanical expa...
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空間轉錄組---特斯拉 TESLAforST
這里的特斯拉不是電動車棒动，是一個最近（May 17芽世，2023）發(fā)表在Cell Systems 上的一個用于空間轉錄組數據分析的工具蠢笋。TESLA (...
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CellDancer細胞不會跳舞我不知道雇卷，但似乎nature biotech的文章代碼會有毒梨睁。鲸睛。。 CellDancer是最新發(fā)表在nature biotechno...
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科技已經被智子鎖死nature 于2023 年年初發(fā)表了一篇文章坡贺，該文章評估了一下過去50年來科研文章的創(chuàng)新性官辈。文章使用了一個叫做CD index 的打分系統：T...
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智能繃帶Nature Biotechnology 發(fā)了一篇無線智能繃帶的文章箱舞，很有意思。萬物既可以智能化啊拳亿。其設計是在電路板上加入了若干感應器晴股，將其貼于...
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為什么CytoTRACE會失效？CytoTRACE是 2020 年發(fā)表在Science 上的一個trajectory 推斷工具肺魁，其原理是基于一個經驗性的觀察电湘，即基因表達數目和發(fā)...
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無知者無畏
最近在做一個SCENIC 下游的分析，看到了一個叫CSI（Connection specificity index）的東西鹅经，大概的原理就是利用A...
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CellRank
---我不生產代碼寂呛，我只是個代碼的搬運工。 今天來盤盤這個新工具瘾晃，這個工具的一大優(yōu)點就是在有或者沒有splicing數據的時候贷痪，都可以用，效果如...