@huang_7 已經(jīng)發(fā)表了棵帽，這篇文章有些多序列結(jié)果分析的流程啊括袒。如果是多序列比對官辈，是MUSCLE吧翘瓮，結(jié)果分析這篇文章有提及贮折。
用PLAM下的mcmctree做分歧時間估計用mcmctree做分歧時間估計的時候遇到報錯： 問題是序列不符合phylip格式，每個名字沒有區(qū)分開 1.使用以下命令行將orthofinder處理好的多序列比對結(jié)果资盅，fa...
@Yorleleiyo 不正常吧调榄，用conda吧‘conda install -c bioconda cafe’
用CAFE做基因家族收縮擴張以下基于cafe 5版本cafe5以前的版本，都需要寫cafe.script,更麻煩呵扛，推薦版本5.常用的cafe參數(shù)為 input文件使用之前做的orthofinder得到的...
越是長大以后越是發(fā)現(xiàn)今穿，所有的計劃和目標缤灵，需要用至少三年的時間澆灌 總結(jié)我所存在的問題： 基本功方法和語言領(lǐng)域知識統(tǒng)計腳本語言腫瘤和醫(yī)學數(shù)據(jù)數(shù)學python和RML基礎(chǔ) 以上用...
申請PhD這段時間，光proposal就寫了4份，而且1-2和3-4還是不同方向腮出。第一份研究計劃也是抓耳撓腮寫了兩個周還多帖鸦，被老師點贊說“nice”。第三份研究計劃因為要的時...
@聰明小崽子 linux安裝一般包括軟件源安裝比如conda胚嘲，源代碼編譯作儿。你說的git安裝，我理解的是github下載軟件馋劈，里面有多種安裝方式攻锰。cafe5的官網(wǎng)document有很多安裝的信息，只要你安裝好了侣滩，不存在所謂的linux還是git,一個東西口注。
用CAFE做基因家族收縮擴張以下基于cafe 5版本cafe5以前的版本变擒，都需要寫cafe.script,更麻煩君珠，推薦版本5.常用的cafe參數(shù)為 input文件使用之前做的orthofinder得到的...
你好，把這段代碼的FALSE改為TRUE就可以了
關(guān)閉Chrome左右滑動時返回上一個網(wǎng)頁我用Mac電腦上用Chrome時娇斑，有一點非常不便讓我常常無語策添。也不知道哪個工程師開發(fā)的功能，這么扯毫缆，每次用觸摸板滑動瀏覽網(wǎng)頁的時候唯竹，它會自動抓取你左滑動或者右滑動，變?yōu)榉祷厣?..
第一個季度完成情況 上個季度的計劃寫的時候內(nèi)容就很多苦丁，那時候又想補短板浸颓，把R語言進階到寫包水平，又剛好加入DAIR團隊實習旺拉，有大量的深度學習工作要做产上。沒想到自己能夠基本完成，...
@貪星的蘑菇 你能不能把你的mcmctree結(jié)果發(fā)給我看一下翠订，因為orthofinder的結(jié)果有有很多巢音，因為這個分析我做的時間很久了有點忘記了細節(jié)，不過我記得orthofinder是不做多序列比對的尽超，多序列比對一般用MUSCLE,orthofinder是聚類的官撼。你最好給我看看你的報錯
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團團 為了把團團帶回山東傲绣，我們費了許多功夫。為了檢驗檢疫證書巩踏，我跑了三趟檢驗檢疫局秃诵。邁著前一天剛練完的腿爬上爬下時，我想我們對團團也是盡心盡力負責了塞琼。多次打電話等位咨詢航空公...
GCN實習 找了一份北大計算機學院的實習工作菠净，老師的方向圖卷積神經(jīng)網(wǎng)絡(luò)，我的目標是做GCN應(yīng)用于生物領(lǐng)域彪杉。目標發(fā)表一篇文章毅往，不要求點數(shù)高，只求口碑好派近。 R工具包 最近在給R打...
剛寫完一個研究計劃攀唯，這個研究計劃收集閱讀整理文獻花了2天，找idea, research gap和寫作花了2天渴丸，一共四天侯嘀。昨晚上寫完的時候，整個人已經(jīng)漿糊了谱轨，深深地感受到了什...
@NEWwitch 你這個是ctl_tree.ctl里面有東西寫錯了戒幔，你看看你是不是參數(shù)（例如-a）寫了沒有具體的數(shù)值。還有一種可能性是你重復(fù)寫參數(shù)了碟嘴。建議你檢查一下你的ctl_tree.ctl溪食，先看是不是打錯字和標點了，再看是否有重復(fù)的參數(shù)娜扇。
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劍鋒 上海交通大學醫(yī)學院附屬瑞金醫(yī)院雀瓢、醫(yī)學基因組學國家重點實驗室在讀研究生（2015年入學）主要感興趣的研究方向：數(shù)據(jù)可視化枢析；高通量測序數(shù)據(jù)分析方法開發(fā)；臨床檢測相關(guān)的軟件和...
我用Mac電腦上用Chrome時，有一點非常不便讓我常常無語。也不知道哪個工程師開發(fā)的功能把沼，這么扯啊易，每次用觸摸板滑動瀏覽網(wǎng)頁的時候，它會自動抓取你左滑動或者右滑動饮睬，變?yōu)榉祷厣?..
@奶咖真好喝 利用Aa和核苷酸租谈，其實是一樣的，就是參數(shù)記得寫成AA就行了捆愁。割去，但是我做的時候直接用的model=0,我認為模型不是最重要的。如果你一直報錯昼丑，我認為應(yīng)該是數(shù)據(jù)格式的問題呻逆。
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@曉栩 這個好難回答咖城，你可以去官網(wǎng)查一下。你是哪種安裝方法胁附，自己編譯源代碼酒繁？
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