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數(shù)據(jù)分析工具推薦 | adaptive-m6A：從RNA序列中鑒定物種特異性m6A修飾位點m6A修飾是真核RNA中最豐富的共轉(zhuǎn)錄修飾鹦筹，在細胞調(diào)控中發(fā)揮著重要作用。近日，《Briefings in Bioinformatics》發(fā)表了一...
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熱點綜述 | 基于人工智能的多組學分析助力癌癥精準醫(yī)學研究多組學技術(shù)和人工智能算法的同步發(fā)展推動了癌癥精確醫(yī)學的發(fā)展。2023年1月《Seminars in Cancer Biology》發(fā)表了一篇綜述...
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NC | 使用GraphST對空間轉(zhuǎn)錄組進行空間信息聚類、整合和去卷積空間轉(zhuǎn)錄組技術(shù)生成具有空間背景的基因表達譜，需要空間信息分析工具來完成三個關(guān)鍵任務：空間聚類、多樣本整合和細胞類型去卷積思币。近日，《Nature ...
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疾病研究資源 | 用于評估疾病相關(guān)性的生物醫(yī)學數(shù)據(jù)土辩、計算方法和工具探索疾病之間的潛在關(guān)系一直是一個活躍的研究領(lǐng)域支救。2022年《Briefings in Bioinformatics》發(fā)表了一篇綜述文章，為當前的...
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Nature子刊 | 將對應分析（CA）應用于scRNA-seq數(shù)據(jù)的降維拷淘、批量整合和可視化有效降維對于scRNA-seq分析至關(guān)重要各墨。主成分分析（PCA）被廣泛使用，但需要連續(xù)的启涯、正態(tài)分布的數(shù)據(jù)贬堵；因此，它經(jīng)常與scRNA-seq應用中...
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數(shù)據(jù)分析工具推薦 | bulkAnalyseR：用于分析和共享批量多組學數(shù)據(jù)的交互式工具包批量測序?qū)嶒灒▎谓M學和多組學）對于探索廣泛的生物學問題至關(guān)重要结洼。為了促進交互式黎做、探索性任務以及共享易于訪問的信息，《Briefings in B...
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BASS：為單細胞分辨率的空間轉(zhuǎn)錄組學提供多尺度和多樣本分析
空間轉(zhuǎn)錄組學研究正在達到單細胞空間分辨率松忍，數(shù)據(jù)通常來自多個組織切片蒸殿。《Genome biology》發(fā)表了一種計算方法BASS，支持單細胞分辨率...
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熱點綜述 | 腫瘤微環(huán)境中的細胞間通信推斷和分析：數(shù)據(jù)資源和計算策略
量化腫瘤微環(huán)境（TME）中各種細胞類型之間和內(nèi)部的串擾宏所，有助于開發(fā)用于腫瘤靶向治療的工具酥艳。《Briefings in Bioinformatic...
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Nature子刊 | 空間轉(zhuǎn)錄組技術(shù)及其發(fā)展方向
2022年10月《Nature Biotechnology》發(fā)表了一篇空間轉(zhuǎn)錄組（ST）技術(shù)的綜述文章爬骤，詳細描述了現(xiàn)有的ST技術(shù)及其發(fā)展方向充石。 ...