前言 最近在看一些關(guān)于生態(tài)椭蹄、遺傳闻牡、基因組進(jìn)化等的文獻(xiàn),其中有個(gè)很多人用的也用了很久的用以判斷物種選擇壓力的數(shù)值绳矩,(Ka/Ks)罩润。發(fā)現(xiàn)在國內(nèi)的資料中比較少,即使有翼馆,也只是教大家...
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前言 最近在看一些關(guān)于生態(tài)椭蹄、遺傳闻牡、基因組進(jìn)化等的文獻(xiàn),其中有個(gè)很多人用的也用了很久的用以判斷物種選擇壓力的數(shù)值绳矩,(Ka/Ks)罩润。發(fā)現(xiàn)在國內(nèi)的資料中比較少,即使有翼馆,也只是教大家...
pyGenomeTracks是什么 首先在介紹pyGenomeTracks之前割以, 先說幾個(gè)常用的表觀組學(xué)數(shù)據(jù)展示工具,IGV应媚,UCSC和WashU严沥。其中大家用的最多的應(yīng)該就是...
作者:Charon審稿:童蒙編輯:amethyst 眾所周知,三代測序的單堿基測序錯(cuò)誤率遠(yuǎn)遠(yuǎn)高于二代測序中姜,PB的單堿基錯(cuò)誤率有10-15%消玄,而ONT也有5-20%[1],那么...
ABBA-BABA分析方法最早發(fā)布于2012年NATURE的文章:Butterfly genome reveals promiscuous exchange of mimic...
三代Pacbio和Nanopore測序技術(shù)的快速發(fā)展推動了比較基因組學(xué)領(lǐng)域的進(jìn)步丢胚,泛基因組構(gòu)建和結(jié)構(gòu)變異識別成為該領(lǐng)域研究前沿翩瓜。其中,共線性分析是比較基因組學(xué)的重要組成部分嗜桌,...
Assembly of whole-chromosome pseudomolecules for polyploid plant genomes using outbred ...
1. ncRNA 非編碼RNA(Non-coding RNA, ncRNA) 包括rRNA奥溺,tRNA,snRNA骨宠,snoRNA 和microRNA 等不編碼蛋白質(zhì)的RNA浮定,它...
通常而言相满,我們會運(yùn)行不只一輪的MAKER。如果參考組序列沒有變化桦卒,那么有一些計(jì)算只需要做一次就行了立美,例如將EST, Repeat和Protein序列比對到參考基因組,得到它們...