基因組中重復序列大體分為兩類:串聯(lián)重復(Tandem repeats,Tandem Duplication) (TRF可預測)散在重復(Dispersed repeats)摔桦,...
基因組中重復序列大體分為兩類:串聯(lián)重復(Tandem repeats,Tandem Duplication) (TRF可預測)散在重復(Dispersed repeats)摔桦,...
Data preparation 繼續(xù)上次的內(nèi)容,下載好數(shù)據(jù)后就可以正式開始鑒定了兄世。首先回顧一下啼辣,下載好的數(shù)據(jù)。 基因組序列信息御滩,存儲基因組序列信息的.fasta文件鸥拧。還有其...
提取基因對應的蛋白質(zhì)官方名 最開始党远,是需要將基因跟其編碼的蛋白質(zhì)對應起來,找遍了各種數(shù)據(jù)庫都沒發(fā)現(xiàn)有相關的注釋文件富弦,Uniprot作為處理蛋白質(zhì)的大佬沟娱,結果里都有,肯定有辦法...
Protein domain: 結構域的概念由Wetlaufer于1973年首次提出腕柜,他定義結構域為可以自動折疊的穩(wěn)定的蛋白質(zhì)結構單位济似。過去,結構域被描述為媳握,折疊單位碱屁,致密結...
最近剛返校,事情比較多蛾找,每天也很忙娩脾,之前寫的《基因家族擴張與收縮分析及物種進化樹構建(上)》也一直沒來得及更新,缺少cafe輸出結果的解讀及后面的可視化打毛。最近在簡書上也收到了...
以下是B站生信技能樹GEO數(shù)據(jù)庫挖掘的課程筆記 主要內(nèi)容及學習目的: 介紹GEO數(shù)據(jù)庫:了解數(shù)據(jù)存放位置柿赊; 介紹GSE項目的3種下載方式; 介紹ID轉換:使用R語言技巧實現(xiàn)基...
1幻枉、基本統(tǒng)計學概念 假設檢驗? 零假設(H0):即原假設? 備擇假設(H1):與零假設對立的假設? 計算零假設(H0)成立的概率? 如果H0成立的概率很低(e.g. 5% o...