@23c0dd34d224 用服務(wù)器了
Day3-單細(xì)胞數(shù)據(jù)fastq及cellrangerSRA-fastq-cellranger 1.conda安裝和管理 2.設(shè)置鏡像 3.創(chuàng)建環(huán)境 4.conda安裝相關(guān)軟件 5.Fastq 其中主要使用的參數(shù)：–gzip：將...
發(fā)簡信
IP屬地：上海
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GEO數(shù)據(jù)庫學(xué)習(xí)總結(jié)（三）ID轉(zhuǎn)換通過前面的數(shù)據(jù)下載，我們一般都可以得到如下矩陣状您，為了后續(xù)分析及文章需要勒叠，我們則需要吧探針名轉(zhuǎn)化為gene_symbol ID轉(zhuǎn)化主要分為二步 Ⅰ、得到探針一一對應(yīng)的基因名Ⅱ膏孟、...
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【單細(xì)胞轉(zhuǎn)錄組】人類T細(xì)胞亞群分析Marker基因匯總T 細(xì)胞（全部）：CD3+ Naive T cell: CD3, CD4, CCR7, CD62L+, IL-7R (CD127), THPOK Tef（效應(yīng)T細(xì)胞）： 輔助...
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Day6-dplyr-S
安裝R包 讀取iris數(shù)據(jù) 1.新增列 新增一列：方法一mutate(test, new = Sepal.Length * Sepal.Width) 新增一列：方法二test...
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Day5-數(shù)據(jù)類型1.設(shè)置工作路徑 setwd('/mnt/SSS/database/Day5') 2.讀取doudou 先看看長什么樣子 再來看一下huahua 兩列之間有空格，所以sep里...
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Day4-單細(xì)胞數(shù)據(jù)降維聚類分群昨天cellranger完后在outs文件夾里面就有這三個(gè)文件了疚察，隨后就可以在R里面讀取這個(gè)單細(xì)胞數(shù)據(jù)了。 1.加載R包及讀取數(shù)據(jù) cellranger完一共有14個(gè)數(shù)據(jù)仇奶，8...
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Day3-單細(xì)胞數(shù)據(jù)fastq及cellrangerSRA-fastq-cellranger 1.conda安裝和管理 2.設(shè)置鏡像 3.創(chuàng)建環(huán)境 4.conda安裝相關(guān)軟件 5.Fastq 其中主要使用的參數(shù)：–gzip：將...
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Day2-單細(xì)胞數(shù)據(jù)SRA下載Linux下載單細(xì)胞數(shù)據(jù) 數(shù)據(jù)準(zhǔn)備 首先找到你想要的數(shù)據(jù)庫该溯，我這邊選擇gse155513岛抄，然后點(diǎn)擊 SPR274643image.png 在Send to選擇File狈茉，F(xiàn)or...
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