發(fā)簡信
IP屬地：青海
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R-Seurat V5 to H5AD
最近想將單細(xì)胞數(shù)據(jù)從Seurat轉(zhuǎn)還到H5AD格式署驻，但發(fā)現(xiàn)Seurat V5直接轉(zhuǎn)換會報錯诡挂。這里記錄一下解決的方案。 直接轉(zhuǎn)換會報錯 Error...
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enONE最近開發(fā)了一個R包，enONE（https://github.com/thereallda/enONE[https://github.com/t...
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Geneformer | 基因分類預(yù)測Gene Classification 上一篇文章寫了用Geneformer如何做細(xì)胞分類[https://thereallda.github....
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Geneformer | 細(xì)胞注釋Geneformer 是一個基于30M scRNA-seq data訓(xùn)練的Transformer模型，訓(xùn)練數(shù)據(jù)包括人類的多種組織器官。Genef...
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scanpy | 基本單細(xì)胞數(shù)據(jù)分析流程scanpy | Preprocessing and clustering 3k PBMCs 本文記錄使用scanpy處理3k PBMCs sc...
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R-抽樣本文簡單介紹幾種重抽樣方法 (in R)耙蔑。 Permutation[#permutation] Bootstrap[#bootstrap] Ja...
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R-搭建R包
本文簡單記錄R包開發(fā)的流程 準(zhǔn)備 創(chuàng)建R包需要用到 devtools，以及usethis 創(chuàng)建Git repo （可選） 如果需要使用Git管理...
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R-SCENIC 單細(xì)胞轉(zhuǎn)錄因子調(diào)控網(wǎng)絡(luò)分析文章接受障斋，終于有空再發(fā)點(diǎn)筆記了?? SCENIC_Tutorial[#scenic_tutorial]Setup[#setup]Load Pack...
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R-建模及預(yù)測Linear Regression[#linear-regression]Model[#model]Prediction[#prediction...