引言 methylKit是一個R軟件包筹煮，用于分析和注釋通過高通量亞硫酸氫鹽測序獲得的DNA甲基化信息不撑。該軟件包旨在處理RRBS及其變體的測序數(shù)據(jù)。但是嫂冻，如果提供正確的輸入格式...
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methylKit甲基化分析
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論文研讀：bioinfomatics|CGmapTools improves the precision of heterozygous SNV calls and supports allel...今天所讀的論文題目是《CGmapTools improves the precision of heterozygous SNV calls and supports all...
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SSH超時斷開(ClientAliveInterval和ClientAliveCountMax )的使用
問題詳解：ssh遠程登錄centos系統(tǒng)，離開一段時間后镜沽，ssh窗口自動斷開茵乱，有時會影響前臺運行的任務(wù)，故而進行解決搜变。1采缚、我們編輯sshd_config文件。vim /etc...
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用R語言對vcf文件進行數(shù)據(jù)挖掘.5 vcf可視化1目錄 前言[http://www.reibang.com/p/729673778e43] 方法簡介[http://www.reibang.com/p/d9bd081763...
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序列比對軟件 MUMmer 結(jié)果文件解讀（三）該系列主要介紹了 MUMmer 軟件下核苷酸序列比對程序 nucmer 的使用挠他，計算操作見前兩篇推文扳抽； 序列比對軟件 MUMmer 快速上手（一）[https://www.j...
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序列比對軟件 MUMmer 簡單上手（一）
MUMmer 4 是一個快速比對 DNA 或蛋白序列的軟件，最常用的 program 就是 nucmer 和 promer殖侵，分別是比對核苷酸和氨基酸序列的贸呢，接下來以 nucm...
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序列比對軟件 MUMmer 結(jié)果可讀化處理（四）
關(guān)于該軟件的計算可選參數(shù)以及結(jié)果文件的解讀，見前三篇分享： 序列比對軟件 MUMmer 快速上手（一）[http://www.reibang.com/writer#/not...
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從零開始學CIRCOS繪制圈圖(四)
通常circos的中間部分不是空白區(qū)域拢军，會用一條條線進行連接贮尉，表示兩個染色體部分區(qū)域有關(guān)系。 數(shù)據(jù)格式 對于link朴沿，circos要求輸入數(shù)據(jù)至少有6列猜谚，分別是chr1 st...
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從零開始學CIRCOS繪制圈圖(五)這一部分承接 從零開始學CIRCOS繪制圈圖(四)，對之前的布局進行調(diào)整赌渣，使結(jié)構(gòu)更加適合于發(fā)表魏铅。 染色體的位置順序 默認情況下是會顯示所有的染色體，而且會先從ath1到ath...
