發(fā)簡(jiǎn)信
IP屬地：遼寧
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了解疫情防控工作方案，祝愿大家健康回家浑劳！
《冬春季農(nóng)村地區(qū)新冠肺炎疫情防控工作方案》 對(duì)農(nóng)村地區(qū)及返鄉(xiāng)人員 相關(guān)防疫工作進(jìn)行部署 《方案》要求加強(qiáng)返鄉(xiāng)人員管理： 返鄉(xiāng)人員需持7天內(nèi)有效 新冠病毒核酸檢測(cè)陰性結(jié)果返鄉(xiāng)；...
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機(jī)器學(xué)習(xí)--有監(jiān)督--GBM(Boosting)集成學(xué)習(xí)(ensemble learning)是采用多個(gè)機(jī)器學(xué)習(xí)模型組合進(jìn)行綜合預(yù)測(cè)，從而提升模型性能的思路揽趾，分為bagging與boosting兩種。之前學(xué)習(xí)的隨機(jī)森林便是...
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R語(yǔ)言ggboxplot-一文掌握箱線圖繪制所有細(xì)節(jié)作者：白介素2相關(guān)閱讀：R語(yǔ)言ggplot2繪制箱線圖R語(yǔ)言生存分析04-Cox比例風(fēng)險(xiǎn)模型診斷R語(yǔ)言生存分析03-Cox比例風(fēng)險(xiǎn)模型R語(yǔ)言生存分析-02-ggforestR...
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Graphpad Prism7 繪制分組箱線圖boxplot參考：GraphPad Prism 繪制箱形圖[http://paper.dxy.cn/article/515137]迟隅、如何用Graphpad Prism 8制作箱型圖[ht...
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技巧（2）——GraphPad Prism作圖|柱狀圖①【題外話】 說(shuō)起作圖智袭，就想起來(lái)本科階段遭遇的各種作圖窘境奔缠，其實(shí)就是簡(jiǎn)單的單因素方差分析等，但是苦于不知道用什么軟件吼野，然后就下載了一堆分析類(lèi)軟件校哎，比如SPSS，DPS瞳步，Exce...
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R語(yǔ)言ggplot2作圖好看的配色備選配色來(lái)源于論文 https://www.nature.com/articles/s41577-022-00707-2[https://www.nature.com/artic...
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【R語(yǔ)言】maftools包計(jì)算腫瘤突變負(fù)荷（TMB）相信很多小伙伴都聽(tīng)過(guò)腫瘤突變負(fù)荷（tumor mutation burden, TMB）闷哆，它是指腫瘤基因組去除胚系突變后的體細(xì)胞突變數(shù)量。定義為每百萬(wàn)堿基中被檢測(cè)出的體細(xì)胞基...
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[富集分析] 3单起、clusterprofile富集分析--下游可視化1抱怔、富集分析的背景知識(shí) - 簡(jiǎn)書(shū) (jianshu.com)[http://www.reibang.com/p/0b938d0e652c]2、clusterprofile富...
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數(shù)據(jù)分析：基于DESeq2結(jié)果的基因富集分析介紹 DESeq2常用于識(shí)別差異基因嘀倒，它主要使用了標(biāo)準(zhǔn)化因子標(biāo)準(zhǔn)化數(shù)據(jù)屈留，再根據(jù)廣義線性模型判別組間差異（組間殘差是否顯著判斷）。在獲取差異基因結(jié)果后测蘑，我們可以進(jìn)行下一步的富集...
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基因集富集分析(Gene Set Enrichment Analysis, GSEA)
前面簡(jiǎn)單介紹過(guò)基因矩陣轉(zhuǎn)置文件格式（* .gmt）[http://mp.weixin.qq.com/s?__biz=MzI4ODE0NTE3OA==&mid=26492005...
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Graphpad繪制森林圖：基本的原理也就是：提供數(shù)據(jù)生成主體（均值灌危、區(qū)間、權(quán)重）碳胳，圖表組件定制（量程勇蝙、坐標(biāo)軸、輔助線）挨约，圖表內(nèi)容結(jié)合： 森林圖：以無(wú)效線（橫坐標(biāo)刻度為0或1）為中心味混，結(jié)合了數(shù)字、文本诫惭、...
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腫瘤變異數(shù)據(jù)分析和可視化工具maftools：突變數(shù)據(jù)下載和可視化本文接上次的內(nèi)容：《腫瘤變異數(shù)據(jù)分析和可視化工具maftools：安裝和文件格式要求[https://byteofbio.com/archives/4.html]》翁锡，本文以T...
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【R語(yǔ)言】蜂群圖+分位線+顯著性或p值前面給大家簡(jiǎn)單介紹了 ? 【R】蜜蜂圖beeswarm[https://link.zhihu.com/?target=http%3A//mp.weixin.qq.com/s%...
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2020-06-01 學(xué)習(xí)maftools : 可視化分析SNV（三）Customizing oncoplots clp 6/1/2020 加載包 讀入數(shù)據(jù) 0.1 Including Transition/Transversions into...
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TCGA數(shù)據(jù)庫(kù)MAF文件的分析以及可視化（maftools包的使用）這兩天“王院長(zhǎng)”幫別人分析snv數(shù)據(jù)，順便給我推薦了一個(gè)R包：maftools贝攒。我看了一下官網(wǎng)盗誊，感覺(jué)是個(gè)非常強(qiáng)大的R包。那必須要學(xué)習(xí)起來(lái)~實(shí)際上網(wǎng)上已經(jīng)有很多教程了，但都是用...
