小杜的生信筆記

引言 在2023年4月6日晃听，Nature Genetics發(fā)表了一篇題目為“Super-pangenome analyses highlight genomic divers...

香波地海

根據(jù)物種基因組和注釋文件忍啤，可以編寫腳本加勤，提取特殊的序列結(jié)構(gòu)，完成個性化的分析同波。本文利用Python3提取擬南芥的最長編碼序列鳄梅，并轉(zhuǎn)化為氨基酸序列輸出到文件中。 基因結(jié)構(gòu) 參考...

六六_ryx

之前分析過的測序數(shù)據(jù)未檩，數(shù)據(jù)質(zhì)量都很好戴尸，給了我一個錯覺質(zhì)控的前后差別不是很大，內(nèi)心里對質(zhì)控這一步也就不是很重視冤狡，跑完質(zhì)控有時也懶得看結(jié)果孙蒙，拿到一批測序數(shù)據(jù)后，也總是忽略了去看測...

白菜代碼小推車

Perl 命令行實戰(zhàn)2 - fastq文件的相關(guān)操作 注：部分代碼可能不太實用筒溃，但是可以用來作為perl的單行程序的練習(xí)马篮。 本文會不斷更新... 目錄 fastq文件的介紹前...

白菜代碼小推車

BUSCO - 組裝質(zhì)量評估軟件 BUSCO - Benchmarking Universal Single-Copy Orthologs 額。直譯的話就是普遍通用的單拷貝直...