發(fā)簡信
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bowtie2比對參考基因組（待續(xù)...）
準(zhǔn)備文件 物種A參考基因組颅和，以及測序文件.fastq 測序文件質(zhì)控 這里用trim_galore悉默，為什么用trim_galore焕阿，因為它可以自動...
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下載和更新R安裝R 選擇鏡像 選擇系統(tǒng) 點base方妖，然后下載 更新R碾局，最好在R gui里更新蛇尚，用installr包來更新就行
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遇到command not found: shopt
遇到問題第一時間百度窝爪，發(fā)現(xiàn)是因為裝了conda的原因，所以修改~/.bashrc中環(huán)境變量會出問題解決辦法如下： 配置完畢蛉鹿，解決問題
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安裝miniconda
首先去清華鏡像https://mirrors.tuna.tsinghua.edu.cn/anaconda/miniconda/找到最新版本然后 ...
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Linux筆記
筆記 在Windows中查看WSL的文件夾 解決Permission denied問題 sudo：是linux系統(tǒng)管理指令伐弹，是允許系統(tǒng)管理員讓普...
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用ClustalW進行多序列比對，IQ-tree構(gòu)建進化樹一榨为、ClustalW進行多序列比對 ClustalW是一種漸進的比對方法惨好，先將多個序列兩兩比對構(gòu)建距離矩陣，反映序列之間兩兩關(guān)系随闺。然后根據(jù)距離矩...
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用TBtools做物種內(nèi)共線性分析（僅步驟）主要是參考https://www.tinymind.net.cn/articles/64d36abc7fd091 首先我們拿到的是以下的材料 1...
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biopython在pip以后import報錯
背景：python版本3.7.4 用pip install biopython成功后日川，發(fā)現(xiàn)import Bio一直報錯，最后經(jīng)過一番折騰矩乐，在ht...
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用python集合比較兩個基因名文件的差異
比較兩個基因名文件的差異 有時候需要比較兩個只有基因名的文件時龄句，可以用將每個文件讀入，并用集合（set）的算法散罕，來比較兩個文件 如： file1...