基因流(也稱基因遷移)是指從一個(gè)物種的一個(gè)種群向另一個(gè)種群引入新的遺傳物質(zhì)毛肋,從而改變?nèi)后w“基因庫”的組成枫耳。通過基因交流向群體中引入新的等位基因乏矾,...
《Large-scale multitrait genome-wide association analyses identify hundre...
進(jìn)行群體遺傳學(xué)分析的前提是我們得得到變異信息,之前已經(jīng)介紹了如何進(jìn)行CNV的識(shí)別迁杨,那么本文來介紹下如何識(shí)別基因組中分布更多钻心、更常見的變異SNP(...
LDSC不僅僅可以用于計(jì)算以及檢驗(yàn)GWAS結(jié)果的inflation是否是因?yàn)榛祀s因素(confounding)的影響仿荆,還可以有S-LDSC(pa...
一析恋、什么是LDSC? image.png LDSC厂财,LD分?jǐn)?shù)回歸狐史,2015年由 Brendan K Bulik-Sullivan 提出的方法痒给,旨...
一、孟德爾隨機(jī)化(Mendelian Randomization骏全, MR)的原理 隨機(jī)對(duì)照實(shí)驗(yàn)(RCT)一般被認(rèn)為是明確因果關(guān)系的金標(biāo)準(zhǔn)苍柏。其要求...
當(dāng)我們拿到某個(gè)研究的GWAS summary data時(shí),因?yàn)榇蠖嗍嵌鷾y序的緣故姜贡,它的SNP ID可能不是正常的rsid试吁,但是,我們下游有些分...
整體腳本如下楼咳,需要你的文件包含CHR BP P三列熄捍,無所謂順序,也無所謂有啥其他列母怜,只要有這三列即可 結(jié)果如下
mwget,m就是multi多線程的意思糙申。mwget是wget的升級(jí)版宾添,支持多線程下載船惨,且默認(rèn)為短點(diǎn)續(xù)傳。 1缕陕、軟件安裝 當(dāng)然粱锐,我是推薦直接在g...