劉小澤寫于19.2.16今天內(nèi)容比較簡單部默，易上手：看看如何作圖評(píng)價(jià)定量結(jié)果 使用Trinity組裝轉(zhuǎn)錄本幢码，并定量后，有了基因或者轉(zhuǎn)錄本的表達(dá)量矩陣，先不用著急去做差異分析戴质，可...
發(fā)簡信
IP屬地：內(nèi)蒙古自治區(qū)
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使用ggupset畫韋恩圖對(duì)于不同數(shù)據(jù)集合的比較的可視化，一般用韋恩圖來表示，但是數(shù)據(jù)集合太多了讨跟，就不好看了纪他，反而不容易從圖中獲得信息了。 三個(gè)集合看起來最合適晾匠。 2012年發(fā)表的香蕉基因組文章中的韋...
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利用R語言分析基因表達(dá)量和預(yù)后的關(guān)系分析基因表達(dá)量和預(yù)后的關(guān)系大體思路為：找出某一癌癥中感興趣的基因表達(dá)量和病人生存時(shí)間的數(shù)據(jù)茶袒，再進(jìn)行生存分析，畫圖 分解起來看 第一步：得到基因表達(dá)量和病人生存時(shí)間相應(yīng)的數(shù)據(jù) ...
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初學(xué)者R語言：外部數(shù)據(jù)導(dǎo)入一.對(duì)于TXT文件 1.對(duì)于簡單文件凉馆，可以簡單讀取薪寓，ex1 <- read.table("ex1.txt") 2.對(duì)于復(fù)雜文件，ex1 <-read.table("文件名如e...
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使用ggord包進(jìn)行PCA分析和作圖PCA（Principal Component Analysis）主成分分析澜共， 用來考察多個(gè)變量間相關(guān)性一種多元統(tǒng)計(jì)方法向叉，研究如何通過少數(shù)幾個(gè)主成分來揭示多個(gè)變量間的內(nèi)部結(jié)構(gòu)...
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初學(xué)者R語言：熱圖基礎(chǔ)畫法及個(gè)性化調(diào)整詳解熱圖（Heatmap）：用顏色變化直觀的表達(dá)數(shù)據(jù)之間差異的圖，是對(duì)實(shí)驗(yàn)數(shù)據(jù)進(jìn)行質(zhì)制和差異數(shù)據(jù)的展現(xiàn)嗦董，是數(shù)據(jù)挖掘類文章的標(biāo)配母谎。 例如上圖，每個(gè)小方格表示每個(gè)基因京革，其顏色表示該基...
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用R語言進(jìn)行相關(guān)性分析：畫出散點(diǎn)圖奇唤、擬合線及標(biāo)注相關(guān)系數(shù)和P值一. 讀取數(shù)據(jù) 因?yàn)槲覀円话阕约轰浀臄?shù)據(jù)都是excel表格的，對(duì)于讀取excel匹摇，此處有一個(gè)小技巧 讀取excel方法 1.把excel文件另存為CSV文件 2.按照讀取cs...
